30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5481 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  85.59 
 
 		 153 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  61.54 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  28.06 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  28.17 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  30.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  26.57 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  26.57 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  32.81 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  28.68 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  28.91 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  28.91 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  25.19 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  23.36 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  24.31 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  25.38 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  24.11 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5728  hypothetical protein  41.18 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  27.21 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  27.34 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  26.62 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  29.91 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  27.43 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  27.43 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  37.88 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  24.31 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  25.42 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  26.55 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>