More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5418 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 583 aa  1122    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.78 
 
 		 542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.41 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.84 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.16 
 
 		 539 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.41 
 
 		 516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.89 
 
 		 502 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
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NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.31 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 		 522 aa  293  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.8 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.56 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.21 
 
 		 613 aa  277  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.65 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.73 
 
 		 498 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.86 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.78 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.14 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.95 
 
 		 489 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
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NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  41.45 
 
 		 457 aa  256  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.34 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.87 
 
 		 497 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.42 
 
 		 537 aa  243  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.66 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.89 
 
 		 479 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 		 489 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
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NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 478 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.53 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.1 
 
 		 528 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 476 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.12 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 		 763 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 476 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 476 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.06 
 
 		 469 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 483 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
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NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 		 534 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.11 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 502 aa  217  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 463 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 		 524 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
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NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  34.14 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
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NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 		 1112 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
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NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.99 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 505 aa  213  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.8 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.93 
 
 		 476 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 490 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.09 
 
 		 527 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4579  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 531 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.63 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.35 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.63 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 469 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.15 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.06 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  31.76 
 
 		 534 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.64 
 
 		 487 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 		 474 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 397 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 457 aa  204  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.05 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.16 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.78 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.46 
 
 		 472 aa  201  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
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NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 		 518 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 646 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 553 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
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NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 646 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  34.57 
 
 		 470 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
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NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
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NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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