More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5390 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
1149 aa  1119    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.71 
 
 
1155 aa  1111    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
1137 aa  882    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 
1177 aa  927    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  49.75 
 
 
1170 aa  1141    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  49.33 
 
 
1172 aa  1126    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  35.64 
 
 
1200 aa  688    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  40.58 
 
 
1937 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
1896 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.4 
 
 
1037 aa  860    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 
1857 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  46.13 
 
 
1137 aa  893    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
1917 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1195 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.46 
 
 
1163 aa  1169    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1142 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
1216 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1937 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.41 
 
 
1158 aa  1134    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  92.13 
 
 
1194 aa  2204    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1201 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
1937 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.56 
 
 
1168 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1195 aa  2412    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 
1141 aa  890    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.59 
 
 
1158 aa  1118    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
1143 aa  888    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 
2107 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 
1356 aa  716    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.33 
 
 
1038 aa  872    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  36.61 
 
 
1158 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.46 
 
 
1155 aa  1113    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
1839 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
1954 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 
1680 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  39.92 
 
 
1374 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
1203 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  73.66 
 
 
1165 aa  1766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.17 
 
 
1155 aa  1112    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
1936 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  35.53 
 
 
1161 aa  663    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  42.41 
 
 
1278 aa  726    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  37.97 
 
 
1196 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 
1713 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
1145 aa  886    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  40.46 
 
 
1695 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.92 
 
 
1155 aa  775    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
2099 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
2037 aa  626  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
2099 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1189 aa  619  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
1964 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
1942 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1131 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
1161 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1162 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
2010 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 
1159 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
1361 aa  482  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1782 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
1816 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
1237 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1303 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  29.09 
 
 
896 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  38.17 
 
 
1392 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  29.28 
 
 
896 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  28.4 
 
 
896 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  28.99 
 
 
896 aa  370  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  28.32 
 
 
896 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1119 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  28.4 
 
 
896 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  28.26 
 
 
896 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
922 aa  370  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  28.96 
 
 
896 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
1159 aa  366  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  28.29 
 
 
896 aa  365  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
896 aa  360  9e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
1482 aa  355  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1847 aa  354  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1853 aa  354  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1843 aa  352  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
920 aa  352  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
1214 aa  351  5e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
1400 aa  345  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 
1406 aa  344  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
1406 aa  343  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
1588 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
916 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
1468 aa  334  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1458 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1179 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
1479 aa  320  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
1792 aa  319  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
1478 aa  310  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  33.9 
 
 
1179 aa  300  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
823 aa  298  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
944 aa  280  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
977 aa  268  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1160 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.38 
 
 
1046 aa  264  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>