More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5355 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  100 
 
 		 383 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  89.82 
 
 		 409 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  77.24 
 
 		 390 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  75.26 
 
 		 391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  73.11 
 
 		 383 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  70.94 
 
 		 383 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  69.53 
 
 		 384 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  69.53 
 
 		 384 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  69.53 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  69.27 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  69.27 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  69.27 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  68.75 
 
 		 384 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  66.49 
 
 		 380 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  66.49 
 
 		 380 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  63.12 
 
 		 380 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  63.38 
 
 		 380 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  62.86 
 
 		 380 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  63.64 
 
 		 380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  63.64 
 
 		 379 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  60.49 
 
 		 411 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  54.29 
 
 		 381 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  54.52 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  54.27 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  54.52 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  54.52 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  54.52 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  54.29 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  54.29 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  54.55 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  53 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  53.65 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  55.53 
 
 		 380 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  52.9 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  55.53 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  54.79 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50.88 
 
 		 384 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  53.27 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.75 
 
 		 381 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  53.65 
 
 		 384 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.13 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.87 
 
 		 381 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  50.25 
 
 		 409 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  50.25 
 
 		 409 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  50 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  50.77 
 
 		 375 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  50 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.77 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  50.26 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  50.26 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.81 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.81 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.81 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.81 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.81 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.81 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.81 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  51.62 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  52.42 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  51.88 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  49.08 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.75 
 
 		 414 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  49.87 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.3 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  49.87 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  49.87 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.23 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  50.4 
 
 		 374 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  52.01 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  52.01 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  52.01 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  49.61 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  49.61 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  49.61 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  49.61 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  49.61 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  47.84 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  47.23 
 
 		 384 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.97 
 
 		 384 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.17 
 
 		 384 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.17 
 
 		 384 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.72 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  51.21 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.17 
 
 		 384 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  51.21 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  53.35 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  46.23 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.72 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  46.01 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  45.57 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  47.93 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  47.93 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  47.93 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  47.93 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  47.93 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  47.41 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  47.3 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  46.87 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  44.97 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>