More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5307 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  100 
 
 		 361 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  80.17 
 
 		 368 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  79.31 
 
 		 368 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  77.75 
 
 		 371 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  79.31 
 
 		 368 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  77.75 
 
 		 371 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  80.17 
 
 		 369 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  80.17 
 
 		 369 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  77.75 
 
 		 371 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  79.6 
 
 		 367 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  77.47 
 
 		 371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  77.47 
 
 		 371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  77.47 
 
 		 371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  77.47 
 
 		 371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  76.92 
 
 		 371 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  79.08 
 
 		 369 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  72.38 
 
 		 370 aa  544  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  46.32 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  46.99 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  46.99 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  46.99 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  46.99 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  46.99 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  46.99 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  46.99 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  46.72 
 
 		 362 aa  288  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  46.37 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  46.37 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  42.78 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  46.5 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  46.65 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  42.78 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  46.22 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  45.94 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  45.94 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  42.53 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  45.18 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  43.27 
 
 		 350 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  43.72 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  43.19 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  43.64 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  37.57 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  39.49 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  39.15 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  38.29 
 
 		 352 aa  222  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  38.15 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  35.77 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  35.77 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  35.49 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  33.33 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.78 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.42 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.42 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.42 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.42 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.33 
 
 		 363 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.42 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  32.12 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.98 
 
 		 355 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.98 
 
 		 355 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.25 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.63 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  33.43 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  32.98 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1343  porin  32.21 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.16 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.09 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  31.28 
 
 		 368 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.99 
 
 		 367 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  32.52 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.76 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  33.54 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  32.16 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  32.28 
 
 		 363 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.96 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.65 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  32.13 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1952  porin  33.43 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0650784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.65 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.96 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1929  porin  32.68 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6150  porin  32.68 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  35.16 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  31.51 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  32.49 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  31.82 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  31.56 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  31.56 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  31.25 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.22 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  31.32 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.21 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  32.02 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.27 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.88 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  31.44 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.7 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.92 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  31.02 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  31.28 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>