77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5278 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
444 aa  882    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  96.36 
 
 
456 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  65.67 
 
 
433 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  57.46 
 
 
431 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  57.51 
 
 
431 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  58.52 
 
 
431 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  57.51 
 
 
431 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  30.54 
 
 
415 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  30.17 
 
 
405 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  31.11 
 
 
409 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  29.57 
 
 
394 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  29.84 
 
 
394 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  29.84 
 
 
394 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  29.84 
 
 
394 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  29.84 
 
 
394 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  29.84 
 
 
394 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  29.84 
 
 
394 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  30 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  29.49 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  29.19 
 
 
392 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  29.97 
 
 
344 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  30.67 
 
 
392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  30.48 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  30.65 
 
 
393 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  30.39 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  30.39 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  30.39 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  30.39 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  30.39 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  30.39 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  27.65 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  30.39 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  30.39 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  31.03 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  30.77 
 
 
393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  27.16 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  27.16 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  27.16 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  27.79 
 
 
381 aa  126  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  30.5 
 
 
393 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  30.5 
 
 
393 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  30.5 
 
 
393 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  27.74 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  27.74 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  27.74 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  27.48 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  27.74 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  27.48 
 
 
392 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  25 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  25 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  29.01 
 
 
393 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  25 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  25.43 
 
 
371 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  26.04 
 
 
402 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  27.63 
 
 
404 aa  94  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  24.04 
 
 
360 aa  90.1  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  38.78 
 
 
160 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  26.04 
 
 
359 aa  86.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  25.25 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  24.53 
 
 
445 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.15 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.68 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  23.41 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
388 aa  60.1  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  23.84 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  21.17 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.67 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  28.57 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
443 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
391 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  29.46 
 
 
447 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>