More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5075 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  73.91 
 
 
517 aa  798    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  73.91 
 
 
522 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  72.07 
 
 
511 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  73.91 
 
 
517 aa  798    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  94.56 
 
 
515 aa  1017    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  72.59 
 
 
516 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  100 
 
 
512 aa  1065    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  72.78 
 
 
516 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  73.05 
 
 
511 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  72.59 
 
 
516 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  75.05 
 
 
513 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  73.91 
 
 
522 aa  798    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  72.99 
 
 
511 aa  777    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  73.91 
 
 
522 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  73.91 
 
 
522 aa  798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  73.52 
 
 
517 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  73.91 
 
 
522 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  63.64 
 
 
518 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  73.17 
 
 
516 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  58.46 
 
 
505 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  58.35 
 
 
505 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  57.48 
 
 
505 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  58.15 
 
 
505 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  59.02 
 
 
503 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  57.91 
 
 
510 aa  591  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  56.44 
 
 
501 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  56.32 
 
 
501 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  57.87 
 
 
503 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  56.3 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  54.71 
 
 
509 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  49.5 
 
 
504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  49.21 
 
 
501 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  49.01 
 
 
501 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  48.81 
 
 
502 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  49.01 
 
 
501 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  47.53 
 
 
502 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  48.13 
 
 
504 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  53.35 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  47.53 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  47.04 
 
 
498 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  47.7 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  45.03 
 
 
512 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  46.25 
 
 
520 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  47.48 
 
 
503 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  31.96 
 
 
489 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.01 
 
 
482 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.66 
 
 
526 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  32.96 
 
 
487 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  30.26 
 
 
586 aa  183  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.89 
 
 
496 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  30.75 
 
 
476 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.93 
 
 
535 aa  179  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  29.33 
 
 
535 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  30.43 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  30.2 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  28.63 
 
 
493 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  31.03 
 
 
572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  29.4 
 
 
474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  29.69 
 
 
523 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  29.71 
 
 
499 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.77 
 
 
501 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.11 
 
 
473 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  29.56 
 
 
511 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  30.19 
 
 
480 aa  160  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  29.74 
 
 
554 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  27.97 
 
 
502 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  29.85 
 
 
486 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.06 
 
 
549 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  30.42 
 
 
536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  28.32 
 
 
481 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  30.39 
 
 
497 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.85 
 
 
508 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  27.39 
 
 
537 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  29.9 
 
 
565 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  25.11 
 
 
480 aa  150  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.28 
 
 
499 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.6 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.85 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.6 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.6 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.6 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.84 
 
 
523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  29.58 
 
 
517 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.37 
 
 
491 aa  148  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.89 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  28.67 
 
 
497 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  28.95 
 
 
483 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  29.42 
 
 
489 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  27.81 
 
 
479 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.24 
 
 
497 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  28.48 
 
 
498 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  29.18 
 
 
518 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  28.28 
 
 
497 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  27.36 
 
 
514 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  29.36 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  28.05 
 
 
497 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  28.05 
 
 
497 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  28.05 
 
 
497 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  27.91 
 
 
478 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  28.76 
 
 
485 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>