More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5006 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 857 aa  1668    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  59.25 
 
 		 855 aa  940    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  76.44 
 
 		 858 aa  1231    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  91.49 
 
 		 846 aa  1452    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  47.89 
 
 		 844 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  44.78 
 
 		 884 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  44.25 
 
 		 868 aa  505  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  43.44 
 
 		 857 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  41.94 
 
 		 867 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  42.98 
 
 		 877 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  42.87 
 
 		 877 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  43.07 
 
 		 866 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  43.89 
 
 		 853 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 		 835 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  40.94 
 
 		 835 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  41.81 
 
 		 855 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  45.41 
 
 		 408 aa  260  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  29.04 
 
 		 850 aa  233  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.57 
 
 		 849 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.62 
 
 		 870 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  31.56 
 
 		 843 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  41.55 
 
 		 445 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 847 aa  210  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 837 aa  205  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  28.25 
 
 		 858 aa  204  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 847 aa  201  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.59 
 
 		 855 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.44 
 
 		 866 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  31.7 
 
 		 843 aa  195  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 839 aa  179  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 		 845 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.12 
 
 		 850 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  28.66 
 
 		 846 aa  152  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.21 
 
 		 851 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.93 
 
 		 855 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 849 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 852 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.28 
 
 		 847 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  35.49 
 
 		 841 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.47 
 
 		 843 aa  111  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  22.54 
 
 		 817 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.53 
 
 		 842 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  23.01 
 
 		 817 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.68 
 
 		 817 aa  105  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.49 
 
 		 842 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.31 
 
 		 848 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 871 aa  99  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  24.85 
 
 		 821 aa  99  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 		 842 aa  98.2  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 853 aa  96.3  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  33.85 
 
 		 842 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 849 aa  94  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  23.32 
 
 		 836 aa  91.3  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  22.88 
 
 		 879 aa  91.3  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  25.03 
 
 		 819 aa  89.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.96 
 
 		 889 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 856 aa  88.6  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.62 
 
 		 835 aa  87.8  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.84 
 
 		 820 aa  87.8  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  21.58 
 
 		 889 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.15 
 
 		 854 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.82 
 
 		 825 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.93 
 
 		 841 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  21.73 
 
 		 884 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 839 aa  82.8  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 		 800 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 834 aa  79.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  23.17 
 
 		 865 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  24.7 
 
 		 840 aa  79  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.71 
 
 		 859 aa  79  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.37 
 
 		 836 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  22.62 
 
 		 845 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  24.42 
 
 		 887 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.1 
 
 		 880 aa  75.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.52 
 
 		 854 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  23.94 
 
 		 897 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 		 855 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  27.7 
 
 		 819 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 873 aa  73.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.9 
 
 		 827 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 842 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  27.7 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  24.24 
 
 		 887 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.23 
 
 		 413 aa  72  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 855 aa  71.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 878 aa  71.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.34 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 855 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  22.77 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  21.7 
 
 		 878 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 873 aa  68.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.65 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2831  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.69 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0414508  hitchhiker  0.00948545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2829  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.48 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.417689  normal  0.0183937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.26 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.58 
 
 		 845 aa  66.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  28.51 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  23.16 
 
 		 889 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>