242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5001 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  55.78 
 
 		 1253 aa  1347    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  46.92 
 
 		 1290 aa  1150    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  48.53 
 
 		 1263 aa  1126    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  55.7 
 
 		 1254 aa  1379    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  77.62 
 
 		 1220 aa  1652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  56.31 
 
 		 1254 aa  1395    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  40.9 
 
 		 1209 aa  786    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.15 
 
 		 1262 aa  828    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  35.17 
 
 		 1258 aa  709    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  48.61 
 
 		 1263 aa  1129    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  41.05 
 
 		 1194 aa  813    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  45.92 
 
 		 1247 aa  1099    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  40.14 
 
 		 1264 aa  801    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  35.84 
 
 		 1253 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  48.52 
 
 		 1288 aa  1162    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  55.78 
 
 		 1253 aa  1346    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  41.6 
 
 		 1193 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  77.7 
 
 		 1281 aa  2010    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  56.3 
 
 		 1257 aa  1394    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  77.62 
 
 		 1220 aa  1652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  31.83 
 
 		 1220 aa  679    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  76.32 
 
 		 1269 aa  1967    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  44.14 
 
 		 1253 aa  1090    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  34.98 
 
 		 1259 aa  694    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  76.42 
 
 		 1269 aa  1953    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  40.27 
 
 		 1207 aa  771    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  40.65 
 
 		 1256 aa  847    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  51.47 
 
 		 1330 aa  1053    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  55.54 
 
 		 1253 aa  1347    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40.41 
 
 		 1242 aa  869    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  76.89 
 
 		 1270 aa  1988    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.7 
 
 		 1245 aa  829    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  41.58 
 
 		 1406 aa  873    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  48.06 
 
 		 1263 aa  1136    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  84.55 
 
 		 1267 aa  2191    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  39.52 
 
 		 1213 aa  799    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  52.04 
 
 		 1240 aa  1174    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  77.65 
 
 		 1278 aa  1996    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  39.71 
 
 		 1364 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  45.13 
 
 		 1286 aa  1011    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  77.39 
 
 		 1281 aa  2004    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  52.14 
 
 		 1293 aa  1306    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  56.88 
 
 		 1248 aa  1356    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  34.19 
 
 		 1255 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  39.38 
 
 		 1207 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  48.63 
 
 		 1260 aa  1142    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  34.36 
 
 		 1298 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  42.11 
 
 		 1222 aa  853    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  42.44 
 
 		 1222 aa  850    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  40.6 
 
 		 1198 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  95.5 
 
 		 1267 aa  2441    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  41.21 
 
 		 1196 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  38.86 
 
 		 1435 aa  853    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  46.91 
 
 		 1247 aa  1035    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  55.33 
 
 		 1248 aa  1360    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  41.44 
 
 		 1444 aa  838    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  48.31 
 
 		 1263 aa  1140    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  76.3 
 
 		 1269 aa  1983    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  40.52 
 
 		 1198 aa  788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  43.04 
 
 		 1237 aa  903    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  43.62 
 
 		 1363 aa  1085    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  55.14 
 
 		 1253 aa  1347    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  47.71 
 
 		 1388 aa  1023    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  76.97 
 
 		 1270 aa  1989    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  56.65 
 
 		 1248 aa  1357    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  76.22 
 
 		 1269 aa  1980    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  76.3 
 
 		 1269 aa  1983    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  36.88 
 
 		 1244 aa  815    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  40.77 
 
 		 1203 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  41.19 
 
 		 1238 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  62.65 
 
 		 1273 aa  1565    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  40.72 
 
 		 1206 aa  785    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  41.05 
 
 		 1191 aa  821    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  49.72 
 
 		 1235 aa  1160    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  33.68 
 
 		 1256 aa  708    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  39.21 
 
 		 1212 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  46.44 
 
 		 1249 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1269 aa  2580    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  40.57 
 
 		 1426 aa  881    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  35 
 
 		 1302 aa  655    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  39.21 
 
 		 1190 aa  746    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  39.75 
 
 		 1175 aa  715    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  40.52 
 
 		 1198 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  40.06 
 
 		 1205 aa  810    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  77.52 
 
 		 1220 aa  1650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  41.73 
 
 		 1409 aa  872    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.62 
 
 		 1245 aa  828    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  46.07 
 
 		 1247 aa  1112    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  46.35 
 
 		 1261 aa  1137    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  35.71 
 
 		 1245 aa  854    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.9 
 
 		 1262 aa  823    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  38.57 
 
 		 1199 aa  748    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  40.18 
 
 		 1453 aa  863    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  38.77 
 
 		 1259 aa  822    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  77.62 
 
 		 1220 aa  1652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  48.22 
 
 		 1273 aa  1127    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.98 
 
 		 1245 aa  843    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  41.96 
 
 		 1266 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  77.54 
 
 		 1281 aa  2007    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  34.05 
 
 		 1304 aa  631  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>