More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4948 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  100 
 
 
386 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  94.04 
 
 
386 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  80.17 
 
 
385 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  73.71 
 
 
383 aa  584  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  66.94 
 
 
384 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  66.94 
 
 
384 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  64.1 
 
 
384 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  64.1 
 
 
384 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  64.1 
 
 
384 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  64.1 
 
 
384 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  64.1 
 
 
384 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  64.1 
 
 
384 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  63.85 
 
 
414 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  64.1 
 
 
384 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  66.67 
 
 
384 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  65.57 
 
 
384 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  65.57 
 
 
384 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  65.57 
 
 
384 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  63.47 
 
 
394 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  61.21 
 
 
383 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  61.99 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  64.01 
 
 
394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  60.47 
 
 
381 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  65.85 
 
 
384 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  63.1 
 
 
383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  58.68 
 
 
382 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  56.3 
 
 
381 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  53.8 
 
 
383 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  49.86 
 
 
377 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  49.49 
 
 
383 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  50.52 
 
 
379 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  50.52 
 
 
379 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  50.52 
 
 
379 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  49.23 
 
 
383 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  50.52 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  50.26 
 
 
379 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  49.73 
 
 
379 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  46.51 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  49.22 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  47.01 
 
 
386 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  50.68 
 
 
380 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  50.26 
 
 
381 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  49.21 
 
 
379 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  49.73 
 
 
380 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  49.32 
 
 
382 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  48.58 
 
 
381 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.09 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  49.09 
 
 
381 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  47.88 
 
 
380 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  47.61 
 
 
379 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.91 
 
 
384 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.91 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.91 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.91 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.91 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.91 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  46.6 
 
 
383 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  45.81 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  44.77 
 
 
389 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  44.77 
 
 
389 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  45.01 
 
 
382 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  45.01 
 
 
382 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.4 
 
 
385 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  44.17 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.15 
 
 
385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  44.5 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  44.22 
 
 
409 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  44.22 
 
 
409 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  45.3 
 
 
380 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  47.91 
 
 
375 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  43.97 
 
 
391 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.91 
 
 
375 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  46.67 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  44.13 
 
 
384 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.86 
 
 
375 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.86 
 
 
375 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.25 
 
 
380 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  44.06 
 
 
380 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.23 
 
 
389 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  44.06 
 
 
380 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  45.31 
 
 
384 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  44.11 
 
 
390 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  43.28 
 
 
383 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.89 
 
 
383 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  41.58 
 
 
380 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.39 
 
 
383 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.39 
 
 
383 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  43.81 
 
 
391 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  44.71 
 
 
377 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  42.56 
 
 
380 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  43.18 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  44.56 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  45.41 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.36 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.36 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.89 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>