175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4917 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  63.74 
 
 
616 aa  806    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  56.19 
 
 
610 aa  704    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  79.41 
 
 
612 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  84.48 
 
 
611 aa  1079    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  80.07 
 
 
612 aa  1027    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  84.8 
 
 
611 aa  1081    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  84.48 
 
 
611 aa  1077    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  84.48 
 
 
611 aa  1078    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  84.8 
 
 
611 aa  1081    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  84.64 
 
 
611 aa  1077    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  57.91 
 
 
611 aa  744    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  84.8 
 
 
611 aa  1081    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  79.25 
 
 
612 aa  1028    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  79.25 
 
 
612 aa  1028    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  79.25 
 
 
612 aa  1025    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  79.41 
 
 
612 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  100 
 
 
612 aa  1253    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  46.13 
 
 
660 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  45.66 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  45.07 
 
 
646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  45.66 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  45.66 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  45.34 
 
 
633 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  45.5 
 
 
616 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  45.5 
 
 
633 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  45.39 
 
 
605 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  45.39 
 
 
605 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  45.39 
 
 
605 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  44.12 
 
 
603 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  44.21 
 
 
620 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  41.11 
 
 
626 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  41.04 
 
 
603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  40.95 
 
 
611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  38.13 
 
 
606 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  37.93 
 
 
606 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  37.6 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  37.62 
 
 
606 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  37.6 
 
 
606 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.32 
 
 
590 aa  339  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.11 
 
 
590 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  34.79 
 
 
605 aa  327  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  34.28 
 
 
609 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  34.55 
 
 
589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  35.31 
 
 
597 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  34.48 
 
 
589 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.19 
 
 
619 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  34.19 
 
 
619 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.6 
 
 
623 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  35.16 
 
 
597 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  33.87 
 
 
619 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  34.62 
 
 
597 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  32.85 
 
 
586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  32.74 
 
 
625 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.03 
 
 
592 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.59 
 
 
624 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  31.02 
 
 
628 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  33.6 
 
 
593 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  33.77 
 
 
582 aa  275  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  32.14 
 
 
623 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  32.14 
 
 
623 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  32.14 
 
 
623 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  32.14 
 
 
623 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  32.14 
 
 
623 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.07 
 
 
629 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  32.14 
 
 
623 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  33.72 
 
 
582 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  31.82 
 
 
630 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  31.98 
 
 
623 aa  267  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  31.82 
 
 
623 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.86 
 
 
630 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  32.23 
 
 
629 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  30.15 
 
 
607 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  31.84 
 
 
623 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.22 
 
 
629 aa  257  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  32.52 
 
 
590 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.28 
 
 
626 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  33.5 
 
 
587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.55 
 
 
629 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  28.93 
 
 
624 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  33.65 
 
 
596 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  30.14 
 
 
626 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  30.36 
 
 
588 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  28.71 
 
 
626 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  28.71 
 
 
626 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  28.71 
 
 
626 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  31.03 
 
 
629 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  31.64 
 
 
620 aa  248  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.03 
 
 
588 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  31.6 
 
 
629 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.51 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  31.51 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  31.51 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  31.6 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  31.51 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.8 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  31.6 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  29.7 
 
 
611 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  30.85 
 
 
608 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  30.73 
 
 
626 aa  244  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  30.63 
 
 
626 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>