56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4896 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  100 
 
 		 564 aa  1150    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  76 
 
 		 554 aa  864    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  76 
 
 		 554 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  75.82 
 
 		 554 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  75.82 
 
 		 554 aa  861    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  74.77 
 
 		 557 aa  846    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  72.46 
 
 		 555 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  76 
 
 		 554 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  74.77 
 
 		 557 aa  846    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  92.31 
 
 		 573 aa  1085    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  73.39 
 
 		 555 aa  811    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  78 
 
 		 626 aa  878    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  74.46 
 
 		 555 aa  849    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  85.02 
 
 		 557 aa  983    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  76 
 
 		 554 aa  864    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  74.41 
 
 		 557 aa  847    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  76 
 
 		 669 aa  864    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  73.19 
 
 		 555 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  55.58 
 
 		 544 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  52.43 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  37.43 
 
 		 541 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  36.72 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  36.2 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  35.4 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  25.73 
 
 		 559 aa  90.5  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  24.59 
 
 		 574 aa  84.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  23.87 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.18 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  24.63 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  23.86 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  25.27 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  24.21 
 
 		 563 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  24.21 
 
 		 563 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.08 
 
 		 601 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  24.83 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  21.48 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  29.79 
 
 		 632 aa  60.1  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  23.84 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  24.05 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  25.97 
 
 		 555 aa  57  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.03 
 
 		 612 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  20.41 
 
 		 616 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  25.82 
 
 		 615 aa  53.9  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  24.38 
 
 		 625 aa  53.5  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  23.93 
 
 		 527 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  34.71 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  29.84 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  23.79 
 
 		 617 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  26.7 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  27.03 
 
 		 610 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 641 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  25.82 
 
 		 607 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.66 
 
 		 607 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  25.27 
 
 		 634 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.44 
 
 		 659 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  23.08 
 
 		 617 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>