More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4892 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  64.56 
 
 		 244 aa  315  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  53.14 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.52 
 
 		 240 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  51.91 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  51.67 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  50.63 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  52.34 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  49.79 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  50.85 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  51.27 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  52.19 
 
 		 252 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  49.36 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  51.48 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  48.75 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  49.79 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  49.37 
 
 		 241 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  50.21 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  48.28 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  49.15 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  47.11 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  50.44 
 
 		 545 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  45.73 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  46.12 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  43.7 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  45.3 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  48.91 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  46.67 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  48.07 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  47.6 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  45.92 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  43.53 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  45.49 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  46.52 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  45.26 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  45.26 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  44.59 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  42.98 
 
 		 509 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  42.98 
 
 		 509 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  42.98 
 
 		 529 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  39.01 
 
 		 489 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  40.71 
 
 		 505 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  50.64 
 
 		 508 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  39.19 
 
 		 532 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  43.86 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  35.04 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  35.27 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  35.71 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  35.68 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.65 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.69 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.58 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  30.15 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  32.74 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.87 
 
 		 427 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.26 
 
 		 413 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.78 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.57 
 
 		 428 aa  89  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.46 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  33.33 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.41 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.54 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  31.88 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  32.04 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.34 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.66 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.25 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.61 
 
 		 615 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  27.69 
 
 		 615 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.06 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.88 
 
 		 438 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.62 
 
 		 437 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.82 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  30.99 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.56 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.41 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  30.51 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  32.16 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.57 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.96 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  28.3 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.55 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  29.38 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.92 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.74 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.02 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.67 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.27 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.72 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.99 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.65 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.57 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>