More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4871 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  100 
 
 		 399 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  92.23 
 
 		 399 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  75.98 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  70.1 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  73.82 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  73.82 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  71.89 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  71.99 
 
 		 405 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  73.82 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  72.61 
 
 		 406 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  71.39 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  68.67 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  65 
 
 		 405 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  67.98 
 
 		 405 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  67.65 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  69.55 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  68.39 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  65.2 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  65.2 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  65.2 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  68.05 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  66.58 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  65.89 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  68.5 
 
 		 409 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  50.51 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  50.25 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  50 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  50.78 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  50.92 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  50.92 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  47.89 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  47.81 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  48.21 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  47.56 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.77 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43.49 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43.49 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43.49 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43 
 
 		 397 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.51 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.79 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  42.51 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.46 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  42.38 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.55 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  40.55 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  40.55 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  40.55 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  40.55 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  40.55 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.3 
 
 		 436 aa  245  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.34 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.3 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  41.82 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  42.78 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.23 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.23 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  40.78 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.99 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.99 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  41.75 
 
 		 430 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  42.3 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  41.75 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.64 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  42.34 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  41.75 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  40.64 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  42.45 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.31 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.3 
 
 		 385 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  39.05 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  41.34 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  41.41 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  41.41 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.52 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  41.15 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.56 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  40.57 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  38.81 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  40.89 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  39.9 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  40.89 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  39.9 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  40.89 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  39.9 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  39.9 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  38.83 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  38.83 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  38.76 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  39.9 
 
 		 430 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  39.9 
 
 		 430 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  39.9 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>