225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4847 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  48.38 
 
 		 1150 aa  1061    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.44 
 
 		 1150 aa  1059    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  88.98 
 
 		 1152 aa  2103    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 1152 aa  2376    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  65.55 
 
 		 1132 aa  1531    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 1146 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.53 
 
 		 572 aa  217  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 889 aa  203  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  30.91 
 
 		 533 aa  201  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  29.75 
 
 		 554 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.24 
 
 		 786 aa  180  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3188  hypothetical protein  32.95 
 
 		 342 aa  153  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  29.02 
 
 		 552 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  29.02 
 
 		 632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  29.02 
 
 		 632 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 696 aa  149  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  29.02 
 
 		 632 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  29.02 
 
 		 632 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  29.02 
 
 		 632 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  29.02 
 
 		 653 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 567 aa  142  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 581 aa  141  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 540 aa  141  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 563 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 		 623 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 657 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.54 
 
 		 569 aa  132  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.98 
 
 		 543 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.98 
 
 		 543 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.8 
 
 		 582 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 		 586 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 547 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.71 
 
 		 593 aa  128  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 		 556 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 578 aa  127  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 578 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.43 
 
 		 565 aa  119  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.92 
 
 		 535 aa  118  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 577 aa  118  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  26.22 
 
 		 578 aa  118  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4478  hypothetical protein  28.42 
 
 		 367 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  hitchhiker  0.00262511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  29.14 
 
 		 364 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1253  esterase/lipase  28.29 
 
 		 354 aa  116  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.09 
 
 		 583 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  29.07 
 
 		 563 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.04 
 
 		 551 aa  112  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  29.85 
 
 		 622 aa  110  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.25 
 
 		 557 aa  109  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.8 
 
 		 552 aa  109  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.88 
 
 		 567 aa  108  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 587 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  26.06 
 
 		 530 aa  105  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 564 aa  102  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  23.24 
 
 		 534 aa  99.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 591 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 591 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 577 aa  97.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 591 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.8 
 
 		 505 aa  95.1  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.29 
 
 		 550 aa  94  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  24.62 
 
 		 745 aa  92.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.42 
 
 		 515 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.35 
 
 		 570 aa  90.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  24.31 
 
 		 547 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 546 aa  87  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.75 
 
 		 563 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.81 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  23.7 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.19 
 
 		 511 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  25 
 
 		 544 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  25.04 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.87 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.48 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  23.44 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.3 
 
 		 562 aa  74.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  28.97 
 
 		 513 aa  73.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  26.86 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  30.64 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 		 559 aa  71.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 556 aa  71.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.89 
 
 		 711 aa  71.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.05 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.22 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  25.17 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.16 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.71 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.57 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.23 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 357 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  24.21 
 
 		 533 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 357 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.57 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.65 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.23 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  25.46 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3189  hypothetical protein  28.35 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00130632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1871  patatin  25.26 
 
 		 499 aa  64.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0785452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  24.01 
 
 		 570 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>