More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4723 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
465 aa  905    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  47.03 
 
 
442 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  46.02 
 
 
450 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46.89 
 
 
461 aa  342  9e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.73 
 
 
468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  44.94 
 
 
451 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.2 
 
 
437 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.47 
 
 
433 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.28 
 
 
437 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.6 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.36 
 
 
437 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.82 
 
 
445 aa  326  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.37 
 
 
439 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.13 
 
 
439 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.13 
 
 
439 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.9 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  42.19 
 
 
439 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.46 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
438 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
461 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.96 
 
 
439 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  45.07 
 
 
442 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  41.63 
 
 
461 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  44.47 
 
 
452 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  41.63 
 
 
461 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  41.63 
 
 
461 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  41.81 
 
 
442 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.31 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  41.95 
 
 
434 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44 
 
 
438 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
442 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 
440 aa  312  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.35 
 
 
436 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.71 
 
 
439 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.48 
 
 
457 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.48 
 
 
457 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.48 
 
 
457 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.54 
 
 
446 aa  309  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.9 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  42.22 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  38.38 
 
 
460 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  37.88 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  43.71 
 
 
445 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  39.29 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.41 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.14 
 
 
430 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.86 
 
 
455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.53 
 
 
458 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  40.7 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 
458 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  43.74 
 
 
456 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 
437 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
452 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.45 
 
 
456 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  38.14 
 
 
465 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.87 
 
 
452 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  39.53 
 
 
435 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  43.71 
 
 
438 aa  299  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  38.32 
 
 
438 aa  299  9e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  38.8 
 
 
438 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  38.8 
 
 
438 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
448 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.53 
 
 
445 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.53 
 
 
445 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.69 
 
 
439 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.53 
 
 
445 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  38.55 
 
 
438 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.55 
 
 
438 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  38.55 
 
 
438 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 
446 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.55 
 
 
450 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  39.29 
 
 
484 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  38.8 
 
 
438 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  41.94 
 
 
450 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  40.69 
 
 
450 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.81 
 
 
430 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  38.55 
 
 
438 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  43.29 
 
 
445 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  39.49 
 
 
447 aa  296  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  40.97 
 
 
449 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  40.97 
 
 
449 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  43.06 
 
 
460 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  40.05 
 
 
447 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  39.71 
 
 
441 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.3 
 
 
441 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.44 
 
 
439 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  40.28 
 
 
443 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  38.48 
 
 
459 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.87 
 
 
443 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  41.81 
 
 
433 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  40.09 
 
 
444 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.44 
 
 
439 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 
457 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  38.5 
 
 
435 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  42.82 
 
 
460 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  39.58 
 
 
436 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.44 
 
 
439 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  39.95 
 
 
436 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>