More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4653 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  831    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  48.82 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  49.64 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  47.16 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  44.87 
 
 		 421 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4365  cis,cis-muconate transporter MucK  46.63 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  29.49 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 428 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  28.09 
 
 		 429 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  28.97 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 420 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 420 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 474 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 474 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  28.82 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 445 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 445 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 399 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 399 aa  136  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  28.7 
 
 		 436 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 399 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  24.88 
 
 		 432 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 399 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 446 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  25.38 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  28.77 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  25.38 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  28.77 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  25.38 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.06 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  28.25 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 457 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 427 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  28.24 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  27.08 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  28.29 
 
 		 429 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  28.24 
 
 		 433 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>