31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4525 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 344 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  96.8 
 
 		 344 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  79.71 
 
 		 344 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  74.32 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  73.87 
 
 		 343 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  68.12 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  70.21 
 
 		 365 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  57.61 
 
 		 365 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  56.13 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  45.56 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  44.31 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  43.25 
 
 		 365 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  48.26 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  42.86 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  42.6 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  42.9 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  42.51 
 
 		 342 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  42.51 
 
 		 342 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  43.41 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  43.41 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  43.11 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  45.42 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  41.92 
 
 		 342 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.24 
 
 		 1061 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  23.3 
 
 		 821 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.36 
 
 		 606 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.36 
 
 		 606 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.16 
 
 		 889 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.76 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  32.94 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  26.77 
 
 		 490 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>