More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4454 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 462 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.62 
 
 		 464 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  91.32 
 
 		 462 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  60.95 
 
 		 461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.39 
 
 		 461 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  59.65 
 
 		 474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  57.3 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  57.97 
 
 		 463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  55.31 
 
 		 461 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  55.97 
 
 		 479 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  56.21 
 
 		 479 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.67 
 
 		 479 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.76 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.1 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  58.73 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  49.78 
 
 		 473 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  52.51 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  46.09 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  44.01 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  47.58 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  46.92 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  43.41 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.11 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  43.84 
 
 		 602 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  44.25 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  41.7 
 
 		 499 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  42.73 
 
 		 470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  42.08 
 
 		 476 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  42.86 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  41.79 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  45.03 
 
 		 465 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  43.6 
 
 		 477 aa  349  8e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  43.7 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  43.21 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  39.09 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  43.04 
 
 		 461 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  42.76 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.82 
 
 		 478 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  43.79 
 
 		 466 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.45 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  42.45 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  40.62 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 		 444 aa  299  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.37 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  35.7 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.92 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.85 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.47 
 
 		 462 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  38.36 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  38.28 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.54 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.66 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.75 
 
 		 471 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.38 
 
 		 490 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 492 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.19 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  32.7 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.17 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.76 
 
 		 596 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.83 
 
 		 705 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  29.72 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.36 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.96 
 
 		 734 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.98 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  30.15 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  30.11 
 
 		 752 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.89 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.22 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  29.15 
 
 		 805 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 		 805 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  28.94 
 
 		 753 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 		 447 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  24.89 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 775 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.22 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.2 
 
 		 462 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  26.2 
 
 		 462 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 726 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.81 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.76 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 		 495 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  29.42 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  35.38 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.23 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.91 
 
 		 462 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>