248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4420 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  95.53 
 
 
425 aa  796  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  100 
 
 
425 aa  823  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  68.01 
 
 
424 aa  582  1e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  68.01 
 
 
424 aa  577  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  68.01 
 
 
424 aa  576  1e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  68.01 
 
 
424 aa  576  1e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  67.77 
 
 
424 aa  575  1e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  67.77 
 
 
566 aa  574  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  67.77 
 
 
424 aa  572  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  67.3 
 
 
426 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  68.81 
 
 
424 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  68.81 
 
 
424 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  68.81 
 
 
424 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  57.04 
 
 
427 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  58.84 
 
 
416 aa  469  1e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  58 
 
 
427 aa  470  1e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  56.47 
 
 
420 aa  469  1e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  58.71 
 
 
418 aa  465  1e-130  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.24283e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  58.84 
 
 
416 aa  467  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  58.23 
 
 
427 aa  467  1e-130  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.61858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  58.71 
 
 
416 aa  460  1e-128  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  57.92 
 
 
425 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  55.76 
 
 
420 aa  454  1e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.84803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  56.09 
 
 
413 aa  454  1e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  54.69 
 
 
420 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.39256e-10  n/a   
 
 
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  59.29 
 
 
423 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  59.29 
 
 
423 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  59.05 
 
 
423 aa  447  1e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  57.48 
 
 
416 aa  446  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  54.01 
 
 
419 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.83947e-06  hitchhiker  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  52.61 
 
 
422 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  58.1 
 
 
415 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  56.32 
 
 
414 aa  441  1e-122  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  55.06 
 
 
419 aa  439  1e-122  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  59.1 
 
 
425 aa  441  1e-122  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  55.06 
 
 
419 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.90778e-07  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  55.06 
 
 
419 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.94256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  56.06 
 
 
416 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  57.24 
 
 
416 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  51.3 
 
 
422 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  55.53 
 
 
419 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.98644e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  57.24 
 
 
416 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  55.82 
 
 
416 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.93356e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  52.61 
 
 
422 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  55.42 
 
 
419 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.46598e-08  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  57.24 
 
 
416 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  55.29 
 
 
419 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.7854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  55.76 
 
 
419 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.65727e-08  hitchhiker  5.17288e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  55.53 
 
 
419 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01153e-05  unclonable  2.54337e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  57.01 
 
 
416 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  55.76 
 
 
419 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.52943e-08  unclonable  1.04739e-10 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  58.16 
 
 
425 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  57.01 
 
 
416 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  55.58 
 
 
416 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  57.01 
 
 
416 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  54.57 
 
 
419 aa  428  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  55.58 
 
 
416 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  55.58 
 
 
416 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  54.25 
 
 
419 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  4.73709e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  54.82 
 
 
419 aa  428  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.93425e-05  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  56.32 
 
 
416 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  55.11 
 
 
416 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  55.58 
 
 
415 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  53.19 
 
 
414 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  55.11 
 
 
416 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  54.98 
 
 
419 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.31174e-08  unclonable  5.78399e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  53.32 
 
 
432 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  56.77 
 
 
416 aa  416  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  57.61 
 
 
416 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  54.44 
 
 
420 aa  415  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  52.12 
 
 
417 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  50.96 
 
 
402 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  48.93 
 
 
406 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  46.67 
 
 
419 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  48.67 
 
 
402 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  47.93 
 
 
418 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  49.52 
 
 
404 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  49.76 
 
 
403 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  49.39 
 
 
408 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  47.95 
 
 
403 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  46.92 
 
 
417 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  48.09 
 
 
402 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  46.93 
 
 
405 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  47.53 
 
 
402 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  44.05 
 
 
406 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  46.78 
 
 
402 aa  357  3e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.13486e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  46.3 
 
 
401 aa  356  4e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  46.3 
 
 
408 aa  352  6e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  44.76 
 
 
399 aa  352  9e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  45.69 
 
 
402 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  45.69 
 
 
402 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.69 
 
 
402 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  45.69 
 
 
402 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  46.77 
 
 
401 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  45.93 
 
 
415 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  45.52 
 
 
403 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.31054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  45.19 
 
 
401 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  45.52 
 
 
403 aa  338  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.45183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  44.12 
 
 
401 aa  337  2e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  44.77 
 
 
403 aa  337  2e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.34447e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>