More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4230 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 363 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  56.68 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  46.2 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  43.52 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 331 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  37.22 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 350 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  36.78 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 462 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.99 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  36.45 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 410 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  32.52 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0400  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 336 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3921  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.441659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0321  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.5557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 321 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1433  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000646594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 339 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  31.27 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  29.3 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  32.8 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  28.12 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  29.1 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 332 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 371 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  29.48 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  31.52 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>