More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4191 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 357 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  80.67 
 
 		 357 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  75.42 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  75.99 
 
 		 356 aa  564  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  74.58 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  75.14 
 
 		 356 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  75.42 
 
 		 356 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  74.86 
 
 		 356 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  74.86 
 
 		 356 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  52.99 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  49.78 
 
 		 229 aa  243  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  41.94 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  46.75 
 
 		 232 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  46.93 
 
 		 229 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  48.47 
 
 		 242 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  46.15 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  47.19 
 
 		 233 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  38.29 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  48.03 
 
 		 249 aa  220  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  37.74 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  47.13 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  47.81 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  47.81 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  38.19 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  46.64 
 
 		 249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  48.05 
 
 		 232 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  48.46 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  48.7 
 
 		 250 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  48.7 
 
 		 250 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  44.13 
 
 		 250 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  37.88 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 		 229 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  47.37 
 
 		 229 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  49.79 
 
 		 239 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  45.68 
 
 		 245 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  44.03 
 
 		 250 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  47.37 
 
 		 250 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  46.05 
 
 		 233 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  46.05 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  45.38 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  45.38 
 
 		 250 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  45.69 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  45.76 
 
 		 248 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  44.44 
 
 		 233 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  44.12 
 
 		 249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.67 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  39.3 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  39.3 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  27.46 
 
 		 778 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  33.83 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  26.2 
 
 		 761 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  32.71 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  31.82 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  31 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  45.71 
 
 		 186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  32.09 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  27.93 
 
 		 759 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 		 293 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.52 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  28.9 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  29.18 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 266 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  30.04 
 
 		 288 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 		 287 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  30.04 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 771 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 208 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.32 
 
 		 209 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 246 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  27.17 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 220 aa  99.8  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  27.72 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 251 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 		 298 aa  99.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 470 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  28.69 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  31.06 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 307 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 291 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 213 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 307 aa  96.3  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>