27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4177 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  100 
 
 
389 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  57.29 
 
 
389 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  55.96 
 
 
389 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  57.83 
 
 
395 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  52.86 
 
 
389 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  57.14 
 
 
387 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  52.34 
 
 
389 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  54.03 
 
 
387 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  57.4 
 
 
387 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  56.62 
 
 
387 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  57.11 
 
 
388 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  57.99 
 
 
390 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  57.88 
 
 
388 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  51.41 
 
 
387 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  51.15 
 
 
394 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  54.76 
 
 
386 aa  352  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  53.8 
 
 
376 aa  342  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  52.58 
 
 
388 aa  342  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  47.78 
 
 
404 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  48.03 
 
 
404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  53.31 
 
 
376 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  48.73 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  50.82 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  50.73 
 
 
380 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  50.6 
 
 
358 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  43.56 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  24.05 
 
 
600 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>