More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4082 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  89.96 
 
 		 281 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  76.6 
 
 		 267 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  74.81 
 
 		 276 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  70.45 
 
 		 270 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  68.06 
 
 		 270 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  72.08 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  67.83 
 
 		 270 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  70.08 
 
 		 270 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  69.58 
 
 		 269 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  69.58 
 
 		 269 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  69.08 
 
 		 270 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  69.47 
 
 		 270 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  69.47 
 
 		 270 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  45.27 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  48.8 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  47.6 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  35.95 
 
 		 425 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  33.18 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  33.18 
 
 		 233 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.06 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.89 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.93 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  29.04 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  29.04 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  28.83 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  32.14 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  28.44 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  29.63 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  29.73 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 239 aa  92.4  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.14 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.59 
 
 		 396 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.64 
 
 		 367 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.85 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 		 239 aa  85.9  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.08 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>