More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4037 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  100 
 
 		 464 aa  930    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  94.78 
 
 		 464 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3957  histidine kinase  75.66 
 
 		 466 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.95 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.21 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.92 
 
 		 455 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.02 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.35 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.35 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1852  sensor histidine kinase  53.99 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0041  sensor histidine kinase  54.21 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2677  sensor histidine kinase  53.99 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0254  sensor kinase protein  54.21 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  55.35 
 
 		 455 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3275  sensor histidine kinase  53.99 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  54.21 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2700  sensor histidine kinase  53.99 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0038  sensor histidine kinase  53.76 
 
 		 459 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  48.6 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  48.39 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  38.01 
 
 		 467 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  41.26 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.17 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  37.91 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 469 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  36.4 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  36.72 
 
 		 474 aa  233  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  37.53 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  37.96 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 477 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.73 
 
 		 500 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  35.97 
 
 		 474 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  35.83 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  33.05 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.54 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 471 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  37.47 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  36.93 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  36.93 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  36.93 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  36.93 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  36.93 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 524 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  35.17 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  34.19 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 459 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  35.21 
 
 		 508 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  35.34 
 
 		 460 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 518 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 505 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 505 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  34.02 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 519 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 505 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.01 
 
 		 505 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.04 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  34.3 
 
 		 817 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  35.15 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  36.54 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  34.98 
 
 		 517 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  34.83 
 
 		 506 aa  196  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  33.26 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  32.83 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  36.41 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  34.32 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 		 515 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  33.84 
 
 		 463 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>