More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4002 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  100 
 
 		 1018 aa  2088    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  78.27 
 
 		 1040 aa  1686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  87.92 
 
 		 1018 aa  1870    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  97.74 
 
 		 1018 aa  2029    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  42.64 
 
 		 1038 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 1038 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  39.3 
 
 		 906 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  39.18 
 
 		 906 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.02 
 
 		 1019 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.18 
 
 		 1013 aa  596  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.02 
 
 		 908 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  37.43 
 
 		 908 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  43.16 
 
 		 1011 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  36.43 
 
 		 1042 aa  529  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.43 
 
 		 865 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  38.32 
 
 		 705 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  33.68 
 
 		 892 aa  476  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  37.34 
 
 		 725 aa  466  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  37.03 
 
 		 727 aa  466  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  35.49 
 
 		 731 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.2 
 
 		 717 aa  452  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  36.22 
 
 		 728 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  37.04 
 
 		 726 aa  452  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  35.96 
 
 		 750 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.15 
 
 		 720 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  35.85 
 
 		 728 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  35.85 
 
 		 731 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  34.49 
 
 		 734 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  34.49 
 
 		 734 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  36.84 
 
 		 712 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  35.74 
 
 		 706 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.81 
 
 		 738 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  34.69 
 
 		 727 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.78 
 
 		 1003 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  34.87 
 
 		 743 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  36.03 
 
 		 753 aa  439  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.15 
 
 		 1024 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 		 720 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  39.43 
 
 		 720 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  36.26 
 
 		 700 aa  433  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 1000 aa  432  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.26 
 
 		 1008 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.26 
 
 		 1008 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  35.59 
 
 		 739 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.51 
 
 		 1001 aa  426  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  34.29 
 
 		 724 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  34.29 
 
 		 724 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.11 
 
 		 759 aa  422  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  34.13 
 
 		 721 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  34.4 
 
 		 738 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.97 
 
 		 1013 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  34.22 
 
 		 721 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  34.2 
 
 		 930 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.76 
 
 		 1016 aa  415  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  33.97 
 
 		 980 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.42 
 
 		 699 aa  413  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  32.43 
 
 		 730 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  34.62 
 
 		 739 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  32.97 
 
 		 726 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.63 
 
 		 739 aa  416  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.94 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  34.57 
 
 		 741 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  32.29 
 
 		 737 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  34.31 
 
 		 716 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  34.4 
 
 		 726 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.32 
 
 		 1012 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  31.44 
 
 		 725 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.7 
 
 		 1006 aa  405  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.38 
 
 		 971 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.94 
 
 		 999 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  34.21 
 
 		 721 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.01 
 
 		 976 aa  399  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  34.23 
 
 		 982 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  35.41 
 
 		 975 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  33.61 
 
 		 720 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  31.34 
 
 		 741 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  33.29 
 
 		 714 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  30.51 
 
 		 986 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  33.97 
 
 		 728 aa  390  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  33 
 
 		 714 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  31.7 
 
 		 719 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  32.77 
 
 		 721 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  31.72 
 
 		 712 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 735 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  33.92 
 
 		 968 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  31.42 
 
 		 712 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  31.45 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  34.79 
 
 		 743 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  32.03 
 
 		 760 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  32.97 
 
 		 716 aa  373  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.19 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  30.37 
 
 		 771 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  31.87 
 
 		 735 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  31.65 
 
 		 715 aa  366  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  30.29 
 
 		 722 aa  365  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  30.78 
 
 		 733 aa  365  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  29.11 
 
 		 802 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.22 
 
 		 720 aa  364  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  29.29 
 
 		 726 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  32.4 
 
 		 740 aa  362  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>