69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3976 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  47.11 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  47.11 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  47.11 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  46.64 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  46.46 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  50.64 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  50.64 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  50.64 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  50.64 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  49.33 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  50.21 
 
 		 246 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  46.09 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  50.44 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  45.09 
 
 		 235 aa  187  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  42.34 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  40.77 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  39.57 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  41.28 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  40.18 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  40.18 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  41.74 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  40.35 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  46.57 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  46.57 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  39.64 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  38.91 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  40.37 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  31.98 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  31.73 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  31.73 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  25.64 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  25.64 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  25.64 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  27.1 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  25.64 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  25.64 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  25.64 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  25 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  25 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  24.36 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  26.39 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1571  CheW-like domain-containing protein  25.52 
 
 		 142 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.603726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  24.16 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.21 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  22.66 
 
 		 318 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  24.32 
 
 		 152 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  24.66 
 
 		 140 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  24.03 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  21.29 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  23.85 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  22.22 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  25.58 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  25.33 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  29.68 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  23.81 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.79 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  23.97 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  23.78 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  25.17 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  25.95 
 
 		 159 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  24.62 
 
 		 336 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  26.85 
 
 		 141 aa  41.6  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  25.83 
 
 		 139 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  31.51 
 
 		 531 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0860  CheW protein  22.56 
 
 		 319 aa  41.6  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288047  normal  0.124717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  23.84 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  24.16 
 
 		 148 aa  41.6  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>