More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3951 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.65 
 
 
520 aa  873    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.04 
 
 
520 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.9 
 
 
520 aa  859    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.69 
 
 
520 aa  869    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.04 
 
 
520 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.81 
 
 
520 aa  878    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  96.62 
 
 
520 aa  984    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.85 
 
 
520 aa  874    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.46 
 
 
520 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.69 
 
 
520 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.65 
 
 
520 aa  870    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.65 
 
 
520 aa  873    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.85 
 
 
520 aa  870    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
520 aa  1041    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.65 
 
 
520 aa  870    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  87.19 
 
 
360 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.33 
 
 
523 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.33 
 
 
523 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.73 
 
 
528 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  57.73 
 
 
528 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  57.73 
 
 
528 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.73 
 
 
527 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.73 
 
 
527 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  57.73 
 
 
528 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.53 
 
 
528 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  57.53 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.53 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.53 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  57.53 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.53 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  57.53 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  57.53 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.06 
 
 
531 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.46 
 
 
531 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.86 
 
 
531 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.86 
 
 
531 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.56 
 
 
523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.27 
 
 
530 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  53.21 
 
 
512 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  52.81 
 
 
512 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  53.01 
 
 
512 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  52.81 
 
 
512 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.12 
 
 
515 aa  555  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.32 
 
 
511 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  52.32 
 
 
511 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  52.32 
 
 
511 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.01 
 
 
511 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.38 
 
 
510 aa  542  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.53 
 
 
511 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  53.01 
 
 
512 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.21 
 
 
513 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  52.81 
 
 
512 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.61 
 
 
511 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  52.91 
 
 
518 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.66 
 
 
544 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  52.5 
 
 
515 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.17 
 
 
518 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.45 
 
 
520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.64 
 
 
537 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.48 
 
 
533 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.6 
 
 
518 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.79 
 
 
522 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
519 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 
519 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  49.19 
 
 
520 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 
519 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 
519 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
515 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.8 
 
 
521 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.97 
 
 
512 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
524 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.97 
 
 
512 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 
519 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  46.97 
 
 
512 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0257273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  46.97 
 
 
512 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  46.97 
 
 
512 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  46.97 
 
 
512 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  47.16 
 
 
512 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  47.16 
 
 
512 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49 
 
 
527 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
519 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  47.16 
 
 
512 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.2 
 
 
511 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.22 
 
 
577 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>