More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3917 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.96 
 
 		 497 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6743  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.72 
 
 		 498 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2536  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  69.54 
 
 		 504 aa  693    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  79.35 
 
 		 499 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  72.95 
 
 		 506 aa  731    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.71 
 
 		 497 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 		 497 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.09 
 
 		 500 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.88 
 
 		 501 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.92 
 
 		 540 aa  863    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 501 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.3 
 
 		 496 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.5 
 
 		 496 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.45 
 
 		 499 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2931  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.92 
 
 		 508 aa  863    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4812  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.94 
 
 		 506 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 		 497 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2619  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.27 
 
 		 522 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.528801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.68 
 
 		 500 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  77.6 
 
 		 507 aa  791    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5671  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  78.13 
 
 		 505 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 		 499 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  80.57 
 
 		 505 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  77.6 
 
 		 507 aa  791    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  69.43 
 
 		 535 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0202  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.92 
 
 		 508 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.15 
 
 		 496 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.3 
 
 		 496 aa  661    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.47 
 
 		 497 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1611  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.92 
 
 		 508 aa  863    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.34 
 
 		 506 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4576  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.54 
 
 		 506 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 		 499 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.34 
 
 		 507 aa  841    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 497 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.55 
 
 		 496 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.56 
 
 		 505 aa  724    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 		 499 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3333  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.52 
 
 		 508 aa  869    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 		 508 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 512 aa  1051    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4547  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  71.49 
 
 		 510 aa  708    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  97.07 
 
 		 512 aa  988    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50080  malonate/methylmalonate semialdehyde dehydrogenase  74.75 
 
 		 499 aa  739    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.69 
 
 		 511 aa  729    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.74 
 
 		 507 aa  843    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1883  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.14 
 
 		 506 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0709118 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.32 
 
 		 503 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 		 496 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 		 499 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 509 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  81.17 
 
 		 505 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.66 
 
 		 506 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.34 
 
 		 506 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.82 
 
 		 504 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 		 496 aa  668    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 		 496 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.33 
 
 		 509 aa  681    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.72 
 
 		 507 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.92 
 
 		 508 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.96 
 
 		 497 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  69.74 
 
 		 506 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.55 
 
 		 496 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.92 
 
 		 540 aa  863    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.15 
 
 		 496 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.13 
 
 		 506 aa  720    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.76 
 
 		 499 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.43 
 
 		 512 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.54 
 
 		 506 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.35 
 
 		 496 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 497 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3996  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.72 
 
 		 508 aa  860    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  62.88 
 
 		 497 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.08 
 
 		 497 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.68 
 
 		 502 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.34 
 
 		 506 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.31 
 
 		 496 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.2 
 
 		 506 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.87 
 
 		 498 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.46 
 
 		 498 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 		 497 aa  618  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.65 
 
 		 508 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2399  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.52 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.55 
 
 		 498 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.45 
 
 		 508 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3578  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.16 
 
 		 498 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.605326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.99 
 
 		 498 aa  614  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.57 
 
 		 508 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0419  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.55 
 
 		 498 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214339  hitchhiker  0.00208567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.55 
 
 		 498 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.35 
 
 		 498 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4044  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.59 
 
 		 498 aa  608  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00766  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.19 
 
 		 496 aa  605  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3302  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.95 
 
 		 537 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0420  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  58.91 
 
 		 499 aa  608  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3662  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.23 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.3 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000699732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3095  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.75 
 
 		 498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.769898  normal  0.126836 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1068  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.56 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3456  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.13 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>