175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3876 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  100 
 
 		 300 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  93.67 
 
 		 298 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  75.86 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  70.33 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  70.86 
 
 		 302 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  70.53 
 
 		 302 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  68.67 
 
 		 295 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  68.67 
 
 		 295 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  68.67 
 
 		 295 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  69 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  69 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  69 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  69 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  69 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  68.67 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  64.67 
 
 		 296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  70.1 
 
 		 300 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  67.27 
 
 		 275 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  58.18 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  54.79 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  54.45 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  58.31 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  54.79 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  53.56 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  50.16 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  55.28 
 
 		 167 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  51.83 
 
 		 163 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  52.15 
 
 		 180 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  50 
 
 		 183 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  52.53 
 
 		 174 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  48.43 
 
 		 179 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  48.43 
 
 		 180 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 180 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  49.69 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  47.4 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  51.13 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  35.39 
 
 		 185 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  68.49 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  46.28 
 
 		 148 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  32.13 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  42.4 
 
 		 136 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  49.45 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  50 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  43.38 
 
 		 137 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  47.52 
 
 		 103 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  42.06 
 
 		 147 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  52.05 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  26.72 
 
 		 537 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  26.72 
 
 		 537 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  35.81 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  36.73 
 
 		 173 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  51.25 
 
 		 112 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  47.73 
 
 		 157 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 140 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 140 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  45.45 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  55.84 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  44.55 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  53.66 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  53.09 
 
 		 161 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  47.44 
 
 		 171 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  43.09 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  55.84 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  42.48 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  47.37 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  33.88 
 
 		 142 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  33.88 
 
 		 142 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  40.68 
 
 		 141 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  53.85 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  53.16 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  52.63 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  52.63 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  44.16 
 
 		 99 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  38.76 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  52.56 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  49.38 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  46.34 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  38.71 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  38.64 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 97 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  41.56 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  51.25 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  41.56 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  41.56 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  41.56 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 99 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 99 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 99 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  43.24 
 
 		 99 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  43.96 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 101 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 97 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  42.11 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 128 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>