26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3859 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  100 
 
 
734 aa  1499    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  45.05 
 
 
1267 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  29.15 
 
 
1242 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0740  hypothetical protein  29.45 
 
 
1269 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261719  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  35.64 
 
 
1264 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  35.64 
 
 
1264 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  31.54 
 
 
1282 aa  158  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  33.11 
 
 
606 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6508  hypothetical protein  32.32 
 
 
1197 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  32.11 
 
 
1183 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  28.39 
 
 
1170 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  28.39 
 
 
1170 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  28.86 
 
 
1160 aa  114  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  29.68 
 
 
305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  28.19 
 
 
1160 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  29.53 
 
 
1160 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  28.19 
 
 
1161 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  28.86 
 
 
1160 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  29.53 
 
 
1160 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  28.32 
 
 
1116 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  25.67 
 
 
1166 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4329  hypothetical protein  24.64 
 
 
519 aa  54.7  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.982381  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  28.29 
 
 
325 aa  48.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  28.02 
 
 
496 aa  47.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  29.76 
 
 
290 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  24.59 
 
 
377 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>