85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3779 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
203 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  83.98 
 
 
206 aa  304  5e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  68.62 
 
 
208 aa  222  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  68.12 
 
 
188 aa  195  4e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  68.42 
 
 
187 aa  193  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  64.33 
 
 
221 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  64.5 
 
 
211 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  64.5 
 
 
211 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  64.5 
 
 
221 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  64.5 
 
 
221 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  64.5 
 
 
221 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  67.11 
 
 
186 aa  189  3e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  63.86 
 
 
164 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  66.45 
 
 
180 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  61.63 
 
 
224 aa  181  9e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  64.42 
 
 
191 aa  179  3e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  65.38 
 
 
193 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  65.38 
 
 
193 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  47.57 
 
 
149 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.19 
 
 
163 aa  84  1e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.52 
 
 
186 aa  79.3  3e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4177  flagellar biosynthesis protein FliO  45.16 
 
 
162 aa  75.9  4e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  48.24 
 
 
112 aa  75.5  5e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  40.37 
 
 
140 aa  73.2  2e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  30.07 
 
 
140 aa  70.9  1e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.86 
 
 
153 aa  70.1  2e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.09 
 
 
136 aa  70.1  2e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  48.24 
 
 
120 aa  69.7  3e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1354  flagellar biosynthesis protein, FliO  48.15 
 
 
159 aa  67  2e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.72 
 
 
163 aa  65.9  4e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1609  flagellar biogenesis protein FliO  40.16 
 
 
144 aa  64.3  1e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796817  normal  0.163037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  35.29 
 
 
140 aa  64.3  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  41.94 
 
 
139 aa  63.9  2e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.84 
 
 
149 aa  63.5  2e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  32.03 
 
 
130 aa  62.8  4e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  34.02 
 
 
144 aa  61.2  9e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.46 
 
 
146 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  33.63 
 
 
146 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  39.22 
 
 
124 aa  59.7  3e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  32.03 
 
 
127 aa  58.9  5e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  32.03 
 
 
127 aa  58.9  5e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 
125 aa  57.8  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 
125 aa  57.8  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 
125 aa  57.8  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 
125 aa  57.8  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 
125 aa  57.8  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.14 
 
 
125 aa  57  2e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  26.04 
 
 
159 aa  57  2e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  28.7 
 
 
151 aa  57  2e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  41.11 
 
 
178 aa  56.2  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  44.83 
 
 
178 aa  55.8  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  30.7 
 
 
150 aa  55.5  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  32.12 
 
 
209 aa  55.1  8e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.13 
 
 
125 aa  53.9  2e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.33 
 
 
136 aa  53.1  3e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  25.23 
 
 
133 aa  52.4  5e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  34.25 
 
 
138 aa  52  6e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 
142 aa  50.4  2e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  27.1 
 
 
124 aa  48.9  4e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  39.29 
 
 
142 aa  48.1  8e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.11 
 
 
166 aa  48.1  9e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  39.29 
 
 
141 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  25 
 
 
127 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  39.29 
 
 
140 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.29 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  39.29 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1291  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.29 
 
 
135 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1358  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.29 
 
 
135 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.21 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 
142 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 
152 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  24 
 
 
144 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  34.15 
 
 
151 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 
150 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  30 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  24.6 
 
 
136 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  26.37 
 
 
136 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  29.87 
 
 
114 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  37.74 
 
 
124 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.49 
 
 
162 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  26.14 
 
 
124 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  38.71 
 
 
139 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  27.5 
 
 
211 aa  41.6  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  29.23 
 
 
120 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>