More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3710 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
408 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
404 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  35.23 
 
 
409 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  34 
 
 
417 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  29.41 
 
 
394 aa  186  8e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28.65 
 
 
428 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
430 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.42 
 
 
428 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.42 
 
 
428 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.42 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.42 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  29.63 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.42 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  29.63 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.38 
 
 
426 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.58 
 
 
436 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.03 
 
 
440 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  27.9 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.82 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.82 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  28.87 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.82 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
449 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  30.03 
 
 
433 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  29.19 
 
 
454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  29.19 
 
 
454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  27.9 
 
 
453 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  27.9 
 
 
453 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  30.17 
 
 
428 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  27.9 
 
 
453 aa  136  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  26.93 
 
 
444 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  26.93 
 
 
444 aa  136  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  26.93 
 
 
444 aa  136  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  26.93 
 
 
444 aa  136  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  26.93 
 
 
444 aa  136  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  26.93 
 
 
444 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  26.93 
 
 
444 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  27.66 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  30.03 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.34 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  27.66 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  26.93 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  27.66 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  27.7 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  28.95 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  29.71 
 
 
436 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  28.47 
 
 
454 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
449 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.06 
 
 
428 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
442 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.07 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  30.29 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  27.2 
 
 
430 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.05 
 
 
423 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.05 
 
 
423 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  27.2 
 
 
430 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.05 
 
 
441 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  30.21 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  27.05 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  27.05 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.81 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.48 
 
 
450 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.81 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.94 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
433 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  26.23 
 
 
444 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.88 
 
 
435 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  26.62 
 
 
433 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  27.05 
 
 
446 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  27.51 
 
 
455 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.62 
 
 
427 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  26.99 
 
 
429 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  28.46 
 
 
433 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  29.07 
 
 
424 aa  124  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.82 
 
 
448 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
433 aa  123  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  28.8 
 
 
455 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.87 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  26.42 
 
 
447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  26.4 
 
 
431 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.87 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.4 
 
 
440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.91 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  26.78 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
422 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  27.35 
 
 
434 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
443 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.67 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  26.38 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>