More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3641 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  97.82 
 
 
275 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  96 
 
 
275 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  95.27 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  95.27 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  95.27 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  95.27 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  95.27 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  94.91 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2629  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000217343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3773  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000105761  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3801  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0211596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3065  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000040785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0252  50S ribosomal protein L2  92.73 
 
 
275 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3743  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000272978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3166  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000940413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1927  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000132135  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3481  50S ribosomal protein L2  92.36 
 
 
275 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000122656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3016  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000236322  decreased coverage  0.00250234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3294  50S ribosomal protein L2  86.23 
 
 
276 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000105073  hitchhiker  0.00000920299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2947  50S ribosomal protein L2  85.51 
 
 
276 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0126826  decreased coverage  0.00000017325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3314  50S ribosomal protein L2  85.87 
 
 
276 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000017691  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3176  50S ribosomal protein L2  84.78 
 
 
276 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0282  50S ribosomal protein L2  81.62 
 
 
277 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161647  hitchhiker  0.00000193986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3335  50S ribosomal protein L2  80.36 
 
 
275 aa  461  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000645842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0056  50S ribosomal protein L2  83.7 
 
 
276 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0408  50S ribosomal protein L2  78.55 
 
 
275 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000019918  normal  0.14889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0770  50S ribosomal protein L2  79.12 
 
 
277 aa  454  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281311  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0053  50S ribosomal protein L2  82.25 
 
 
276 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000139225  hitchhiker  1.23059e-22 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0322  50S ribosomal protein L2  80 
 
 
275 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000249804  unclonable  0.0000000454999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3996  50S ribosomal protein L2  77.74 
 
 
274 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000189322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1267  50S ribosomal protein L2  78.47 
 
 
274 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000012359  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3440  50S ribosomal protein L2  78.47 
 
 
274 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00120945  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0259  50S ribosomal protein L2  77.01 
 
 
274 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00667952  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0206  50S ribosomal protein L2  76.64 
 
 
274 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  74.26 
 
 
273 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3792  50S ribosomal protein L2  75.91 
 
 
274 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  74.26 
 
 
273 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0341  50S ribosomal protein L2  75.55 
 
 
274 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0360298  decreased coverage  0.000304733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4910  50S ribosomal protein L2  76.28 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000776237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0281  50S ribosomal protein L2  75.18 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  hitchhiker  0.00000000167888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0276  50S ribosomal protein L2  75.18 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000196906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0394  50S ribosomal protein L2  75.91 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000662922  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0870  50S ribosomal protein L2  73.36 
 
 
274 aa  411  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06280  50S ribosomal protein L2  74.63 
 
 
273 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  70.55 
 
 
274 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 
274 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 
274 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4273  50S ribosomal protein L2  72.63 
 
 
274 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288433  unclonable  0.00000000000501812 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 
274 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  71.27 
 
 
274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0963  50S ribosomal protein L2  73.09 
 
 
275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00625904  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  70.8 
 
 
273 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 
273 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  71.17 
 
 
273 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0457  50S ribosomal protein L2  73.63 
 
 
274 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.271317  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4746  50S ribosomal protein L2  73.63 
 
 
274 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00153291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0629  ribosomal protein L2  73.63 
 
 
274 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000177607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4545  50S ribosomal protein L2  73.63 
 
 
274 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0677044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5076  50S ribosomal protein L2  73.63 
 
 
274 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000626966  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00448  50S ribosomal protein L2  72.99 
 
 
274 aa  401  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3521  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 
275 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000287143  hitchhiker  0.00000119311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0424  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0891588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  70.8 
 
 
273 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0487  50S ribosomal protein L2  73.26 
 
 
274 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0341387  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0490  50S ribosomal protein L2  73.63 
 
 
274 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000253797  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
273 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00733  50S ribosomal protein L2  72.26 
 
 
274 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0323  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 
274 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2171  50S ribosomal protein L2  73.72 
 
 
274 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000003452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0472  50S ribosomal protein L2  72.63 
 
 
274 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000311263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0161  50S ribosomal protein L2  70.55 
 
 
275 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128131  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3906  50S ribosomal protein L2  72.89 
 
 
274 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0187  50S ribosomal protein L2  69.82 
 
 
275 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000586995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0216  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 
274 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000116204  unclonable  0.00000865154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 
274 aa  390  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001739  LSU ribosomal protein L2p (L8e)  71.53 
 
 
274 aa  390  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3756  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 
274 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0234  50S ribosomal protein L2  69.34 
 
 
274 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0722  50S ribosomal protein L2  70.22 
 
 
275 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000807709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4167  50S ribosomal protein L2  69.34 
 
 
274 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617746  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  70.07 
 
 
273 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0202  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 
274 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000118322  unclonable  0.0000000000286265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0197  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 
274 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0317166  decreased coverage  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0151  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 
274 aa  387  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0202  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 
274 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000998768  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>