More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3630 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
131 aa  261  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.54136e-05  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
131 aa  261  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.97619e-06  decreased coverage  1.24793e-12 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  96.95 
 
 
131 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  96.18 
 
 
131 aa  253  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  96.18 
 
 
131 aa  253  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  3.92794e-07  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  96.18 
 
 
131 aa  253  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  96.18 
 
 
131 aa  253  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.061e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  96.18 
 
 
131 aa  253  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.09852e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  96.18 
 
 
131 aa  253  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  3.15626e-07  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  94.66 
 
 
131 aa  251  2e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  6.57656e-05  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  1.28186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.92873e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  93.89 
 
 
131 aa  250  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  85.5 
 
 
131 aa  229  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  83.97 
 
 
131 aa  228  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  83.21 
 
 
131 aa  228  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  83.97 
 
 
131 aa  227  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  1.96614e-07  hitchhiker  2.44921e-06 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  83.97 
 
 
131 aa  227  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  8.26655e-07 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  83.21 
 
 
131 aa  226  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.92861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  83.97 
 
 
131 aa  226  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  1.59627e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  84.73 
 
 
131 aa  224  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  81.68 
 
 
131 aa  225  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  83.97 
 
 
131 aa  224  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  1.85574e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  83.97 
 
 
131 aa  224  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  83.21 
 
 
131 aa  223  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  82.44 
 
 
131 aa  221  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.54539e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0334  30S ribosomal protein S8  81.68 
 
 
131 aa  217  4e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000103559  hitchhiker  0.000409506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  80.92 
 
 
131 aa  214  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  79.39 
 
 
131 aa  214  3e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.52194e-15  unclonable  4.69297e-08 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  80.15 
 
 
131 aa  214  3e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  78.63 
 
 
131 aa  213  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.37116e-07  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0067  30S ribosomal protein S8  78.63 
 
 
131 aa  211  2e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  5.54251e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  78.63 
 
 
131 aa  212  2e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  77.86 
 
 
131 aa  209  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  2.56719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  75.57 
 
 
131 aa  209  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  77.86 
 
 
131 aa  206  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.01121e-11  hitchhiker  2.01574e-06 
 
 
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  70.23 
 
 
131 aa  197  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.03227e-09  unclonable  7.39307e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  70.23 
 
 
130 aa  190  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.75754e-08  hitchhiker  1.41072e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  70.23 
 
 
130 aa  190  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  70.23 
 
 
130 aa  190  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.67533e-07  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  70.23 
 
 
130 aa  190  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.80848e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  70.23 
 
 
130 aa  190  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  1.47865e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  70.23 
 
 
130 aa  190  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.95155e-06  decreased coverage  5.1786e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  69.47 
 
 
130 aa  189  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.74735e-05  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  69.47 
 
 
130 aa  189  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.63512e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  69.47 
 
 
130 aa  189  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.22909e-05  unclonable  3.13714e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  69.47 
 
 
130 aa  189  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.45166e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  67.94 
 
 
130 aa  187  3e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.21054e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  67.94 
 
 
130 aa  186  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.40573e-05  unclonable  8.98737e-09 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0074  30S ribosomal protein S8  67.18 
 
 
130 aa  185  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  5.74269e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  66.41 
 
 
130 aa  184  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.80901e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4303  30S ribosomal protein S8  67.18 
 
 
130 aa  182  2e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.2409e-08  unclonable  5.62401e-11 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  66.41 
 
 
130 aa  181  2e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.2701e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  65.65 
 
 
130 aa  182  2e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.0833e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  67.69 
 
 
130 aa  181  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0419  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  180  5e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000465732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3737  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  180  5e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.62987e-06  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  180  5e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.33012e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  2.18378e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.72145e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.45465e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  4.52809e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.8536e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  64.12 
 
 
130 aa  179  8e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  1.88552e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00744  30S ribosomal protein S8  64.89 
 
 
130 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  177  5e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  67.69 
 
 
130 aa  177  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  3.05932e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3987  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
130 aa  177  5e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0073999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  67.69 
 
 
130 aa  177  5e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0597  30S ribosomal protein S8  61.83 
 
 
130 aa  177  6e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.01428e-08  normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  61.83 
 
 
130 aa  177  6e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  7.47182e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  61.83 
 
 
130 aa  177  6e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.34775e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  66.15 
 
 
130 aa  176  6e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  3.05934e-14  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001728  SSU ribosomal protein S8p (S15Ae)  64.12 
 
 
130 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.20739e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4530  30S ribosomal protein S8  61.83 
 
 
130 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.4022e-07  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3895  30S ribosomal protein S8  67.69 
 
 
130 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  5.90966e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  64.62 
 
 
131 aa  175  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  65.38 
 
 
130 aa  175  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  1.65521e-08  hitchhiker  9.73471e-07 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  61.07 
 
 
131 aa  174  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  66.15 
 
 
189 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  5.83772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  64.89 
 
 
130 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  63.08 
 
 
130 aa  174  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0770  30S ribosomal protein S8  63.64 
 
 
132 aa  174  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.049997  normal  0.0124974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00952  30S ribosomal protein S8  65.65 
 
 
130 aa  173  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 
131 aa  173  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4735  30S ribosomal protein S8  66.92 
 
 
130 aa  171  2e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000117347  normal  0.480985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0501  30S ribosomal protein S8  66.92 
 
 
130 aa  172  2e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  6.11084e-07  normal  0.097534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>