162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3575 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  748    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  94.68 
 
 		 376 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  85.11 
 
 		 386 aa  634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  78.61 
 
 		 377 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  79.52 
 
 		 378 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  79.52 
 
 		 378 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  79.79 
 
 		 378 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  78.72 
 
 		 378 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  77.81 
 
 		 377 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  77.81 
 
 		 377 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  77.54 
 
 		 377 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  77.54 
 
 		 377 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  77.54 
 
 		 377 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  77.54 
 
 		 377 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  77.27 
 
 		 377 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  78.4 
 
 		 378 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  78.19 
 
 		 378 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  78.72 
 
 		 378 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  58.47 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  56.62 
 
 		 381 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  56.62 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  56.47 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  57.3 
 
 		 402 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  53.08 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  52.57 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  52.62 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  49 
 
 		 374 aa  302  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  52.68 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  48.07 
 
 		 358 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  38.76 
 
 		 340 aa  262  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  38.76 
 
 		 340 aa  262  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  45.16 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  41.64 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  41.64 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 350 aa  252  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  38.03 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  42.77 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.97 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 354 aa  238  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  41.94 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  42.47 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  41.59 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  42.42 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  41.39 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  41.12 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  41.12 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 325 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  39.42 
 
 		 360 aa  209  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  38.27 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  39.14 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  39.02 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  38.28 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  38.74 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  38.15 
 
 		 324 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  36.2 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  38.48 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.33 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  34.05 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.18 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  30.61 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  32.7 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.38 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.84 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  29.28 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.78 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  30.95 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  31.74 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  31.74 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  31.74 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  30.63 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  31.74 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  29.77 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  32.12 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  33.23 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.78 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.44 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.53 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  28.49 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  27.79 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  30.6 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  29.43 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  28.27 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.69 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  27.19 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  27.15 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>