224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3504 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  100 
 
 
241 aa  497  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  96.68 
 
 
241 aa  467  1e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  82.16 
 
 
241 aa  417  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  76.67 
 
 
242 aa  398  1e-110  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  76.67 
 
 
242 aa  398  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  76.67 
 
 
242 aa  398  1e-110  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  75.42 
 
 
242 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  75.42 
 
 
242 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  75 
 
 
242 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  74.58 
 
 
242 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  75.1 
 
 
242 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.69 
 
 
242 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.69 
 
 
245 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.69 
 
 
242 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.69 
 
 
242 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.69 
 
 
245 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.69 
 
 
242 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.69 
 
 
242 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  58.26 
 
 
248 aa  268  6e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  57.8 
 
 
248 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  50.81 
 
 
248 aa  265  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  52.58 
 
 
252 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  52.51 
 
 
249 aa  254  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
240 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.34 
 
 
236 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  45.34 
 
 
236 aa  234  1e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  49.76 
 
 
246 aa  233  1e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  46.46 
 
 
233 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.07 
 
 
247 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  48.7 
 
 
241 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.16 
 
 
272 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  44.49 
 
 
237 aa  220  1e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  44.5 
 
 
246 aa  219  2e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  46.29 
 
 
242 aa  220  2e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  47.14 
 
 
237 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  44.64 
 
 
245 aa  218  9e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  42.92 
 
 
238 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  45.11 
 
 
235 aa  211  6e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.89 
 
 
237 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.29 
 
 
236 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  44.29 
 
 
246 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  45.25 
 
 
239 aa  197  2e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  43.44 
 
 
238 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  42.57 
 
 
249 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  40.34 
 
 
281 aa  184  1e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  36.88 
 
 
272 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  39.8 
 
 
254 aa  164  1e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.4 
 
 
272 aa  162  5e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  34.03 
 
 
276 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  35.37 
 
 
282 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  29.48 
 
 
256 aa  130  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  35.18 
 
 
237 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.12 
 
 
241 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.04 
 
 
245 aa  121  1e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.92 
 
 
254 aa  117  1e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  32.64 
 
 
255 aa  117  2e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.86 
 
 
242 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  5.49688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  32.99 
 
 
253 aa  115  8e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.28 
 
 
242 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.82 
 
 
242 aa  113  2e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  31.19 
 
 
243 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30.45 
 
 
245 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.01453e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  31.67 
 
 
246 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  30.86 
 
 
244 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.51 
 
 
246 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.62 
 
 
294 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.67 
 
 
260 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.93 
 
 
247 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.93 
 
 
247 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  29.69 
 
 
260 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  7.6837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  31.93 
 
 
269 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.19156e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  28.7 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.09 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.89 
 
 
210 aa  99.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  30.69 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.07273e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  28.7 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.81 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.81 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.81 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.81 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  28.81 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.15 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  27.36 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.09 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.8 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  27.94 
 
 
284 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.97952e-08  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
265 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  28.22 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 
262 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.6 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.6 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.78 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.77 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.48 
 
 
241 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.43 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.43 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  25.6 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  28.33 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.41 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>