More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3424 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  100 
 
 
183 aa  373  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  91.11 
 
 
180 aa  337  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  69.78 
 
 
182 aa  239  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  61.64 
 
 
183 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  62.26 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  62.26 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  62.26 
 
 
183 aa  210  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  60 
 
 
183 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  58.15 
 
 
184 aa  207  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  61.64 
 
 
182 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  61.73 
 
 
202 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  58.06 
 
 
202 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  58.06 
 
 
186 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  58.06 
 
 
186 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  58.6 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  58.6 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  58.6 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  58.6 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.86 
 
 
174 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  45.6 
 
 
174 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  41.76 
 
 
174 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  49.28 
 
 
180 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.56 
 
 
175 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  46.76 
 
 
182 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  38.8 
 
 
178 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  44.62 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.47 
 
 
195 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  42.47 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  42.07 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.63 
 
 
195 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  49.12 
 
 
195 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  41.18 
 
 
188 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  39.16 
 
 
172 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  39.01 
 
 
171 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.28 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 
190 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  41.86 
 
 
184 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.44 
 
 
183 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.33 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
167 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  42.86 
 
 
135 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  35.77 
 
 
165 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  37.04 
 
 
164 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.66 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.48 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  30.34 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  33.9 
 
 
173 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.09 
 
 
182 aa  89  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.46 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  33.85 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  36.49 
 
 
184 aa  85.5  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  35.61 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.94 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.08 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  35.66 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.82 
 
 
655 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.94 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  33.33 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  38.17 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.92 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  37.93 
 
 
447 aa  81.3  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  31.78 
 
 
466 aa  81.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  33.59 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.37 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  30.32 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.7 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  37.29 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  33.85 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.06 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  37.69 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  32.82 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  34.13 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  39.06 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  33.62 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  37.5 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  31.43 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36.36 
 
 
193 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  37.74 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  34.53 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.17 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  31.54 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  29.49 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00935  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like protein  37.93 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  32.82 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.18 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  30.67 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  31.1 
 
 
248 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  34.82 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.81 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.34 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  33.07 
 
 
269 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  33.55 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  34.84 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.34 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.4 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>