More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3335 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
252 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  80.56 
 
 
251 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  64.43 
 
 
250 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  64.43 
 
 
250 aa  339  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  64.03 
 
 
250 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  65.61 
 
 
250 aa  338  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  61.9 
 
 
252 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  61.51 
 
 
252 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  63.6 
 
 
250 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  303  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  303  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  57.94 
 
 
252 aa  303  1e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  57.94 
 
 
252 aa  303  1e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  303  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  57.94 
 
 
252 aa  303  1e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  57.94 
 
 
252 aa  303  1e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 
253 aa  303  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  57.94 
 
 
252 aa  303  2e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  57.94 
 
 
252 aa  303  2e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  57.94 
 
 
252 aa  303  2e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  57.54 
 
 
252 aa  301  6e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  58.33 
 
 
253 aa  301  7e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  57.87 
 
 
254 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.12622e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  57.87 
 
 
254 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  57.87 
 
 
254 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  57.87 
 
 
254 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.61576e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  57.87 
 
 
254 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  57.48 
 
 
262 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.05539e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  57.48 
 
 
254 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.5723e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  65.71 
 
 
253 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  65.31 
 
 
253 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  59.92 
 
 
252 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  60 
 
 
254 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  60.09 
 
 
235 aa  289  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.23036e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  64.49 
 
 
253 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  59.32 
 
 
252 aa  288  5e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  58.47 
 
 
252 aa  285  6e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  1.12328e-10 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  63.48 
 
 
249 aa  285  6e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  58.43 
 
 
250 aa  283  2e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  65.31 
 
 
253 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  64.08 
 
 
253 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  64.08 
 
 
253 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  57.77 
 
 
251 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  63.6 
 
 
250 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  65.64 
 
 
250 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  64.08 
 
 
604 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  58.13 
 
 
254 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  57.74 
 
 
261 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  42.62 
 
 
312 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  46.45 
 
 
275 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  41 
 
 
256 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  42.52 
 
 
269 aa  164  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  41.36 
 
 
290 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  38.97 
 
 
289 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  2.69933e-07 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.9 
 
 
271 aa  84  2e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.43 
 
 
267 aa  84.3  2e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.30567e-07  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31.55 
 
 
293 aa  82.8  4e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  26.54 
 
 
270 aa  82  8e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  25.85 
 
 
271 aa  80.9  2e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  28.02 
 
 
311 aa  80.9  2e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 
424 aa  79.7  4e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  27.1 
 
 
280 aa  79.3  5e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
305 aa  79  7e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 
291 aa  79  7e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  26.07 
 
 
270 aa  78.6  8e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.49 
 
 
272 aa  77.8  1e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.66595e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 
289 aa  77.4  2e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51059e-07 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  29.68 
 
 
288 aa  77.4  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 
260 aa  77  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 
260 aa  77  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.75 
 
 
264 aa  76.6  4e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  29.15 
 
 
255 aa  76.6  4e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  26.78 
 
 
284 aa  76.3  5e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  26.04 
 
 
268 aa  75.9  6e-13  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.25 
 
 
266 aa  75.5  7e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.70092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  29.11 
 
 
263 aa  75.1  9e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  26.15 
 
 
274 aa  75.1  1e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  24.23 
 
 
263 aa  73.9  2e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.86 
 
 
258 aa  73.6  3e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 
281 aa  73.6  3e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.36 
 
 
271 aa  72.8  5e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  26.4 
 
 
269 aa  72.8  5e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  28.5 
 
 
279 aa  72.8  5e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 
272 aa  72.8  6e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
289 aa  72.4  6e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  34.19 
 
 
275 aa  72.4  6e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 
272 aa  72.4  6e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  30.48 
 
 
280 aa  72.4  6e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  25.1 
 
 
269 aa  72  9e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  26.5 
 
 
254 aa  71.6  1e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  3.19394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  26.89 
 
 
266 aa  71.2  1e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
496 aa  71.2  1e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 
292 aa  71.6  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  30.87 
 
 
284 aa  71.2  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  28.88 
 
 
292 aa  70.9  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 
268 aa  71.2  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  26 
 
 
269 aa  70.9  2e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.46898e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  27.95 
 
 
422 aa  70.5  2e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  26 
 
 
269 aa  70.9  2e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>