More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3326 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
388 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  96.91 
 
 
388 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  89.24 
 
 
392 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  82.98 
 
 
391 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  83.6 
 
 
391 aa  620  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  83.86 
 
 
391 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  83.6 
 
 
416 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  82.2 
 
 
391 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  82.8 
 
 
391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  82.23 
 
 
391 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  80.95 
 
 
390 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  79.63 
 
 
390 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  79.37 
 
 
390 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  79.63 
 
 
390 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  79.63 
 
 
390 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  79.63 
 
 
390 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  79.63 
 
 
390 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  79.63 
 
 
390 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  61.38 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  61.11 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  61.11 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  61.11 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  58.2 
 
 
385 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  60.86 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  60.86 
 
 
388 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  59.38 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  62.95 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  63.69 
 
 
389 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  63.69 
 
 
389 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  63.41 
 
 
389 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  59.28 
 
 
405 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  63.13 
 
 
389 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  63.13 
 
 
389 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  63.41 
 
 
389 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  63.13 
 
 
389 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  59.66 
 
 
388 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  59.94 
 
 
388 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  63.13 
 
 
389 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  54.64 
 
 
408 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  58.17 
 
 
397 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  61 
 
 
393 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
392 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  55.41 
 
 
388 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  55.41 
 
 
388 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  56.84 
 
 
389 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  57.51 
 
 
385 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  58.54 
 
 
384 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  58.86 
 
 
386 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  58.86 
 
 
386 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  58.86 
 
 
386 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  54.92 
 
 
412 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  59.66 
 
 
388 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  59.1 
 
 
388 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  54.21 
 
 
406 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  54.06 
 
 
378 aa  358  9e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  51.08 
 
 
388 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
391 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  52.04 
 
 
391 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  52.97 
 
 
406 aa  342  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  52.85 
 
 
391 aa  342  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.68 
 
 
388 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  50.98 
 
 
402 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  50.55 
 
 
396 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  52.14 
 
 
407 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 
391 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  53.89 
 
 
391 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  54.44 
 
 
391 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  51.57 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  50.26 
 
 
391 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  49.48 
 
 
391 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  49.74 
 
 
391 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  49.61 
 
 
400 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  53.6 
 
 
391 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  49.61 
 
 
400 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 
406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  49.74 
 
 
400 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  49.22 
 
 
391 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  49.22 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  49.35 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  49.48 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  52.74 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  49.48 
 
 
400 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  49.48 
 
 
391 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 
393 aa  322  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 
400 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  47.38 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  50.99 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  53.01 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  47.38 
 
 
395 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  48.97 
 
 
409 aa  319  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  50.52 
 
 
400 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  49.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  49.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  49.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  49.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  47.58 
 
 
404 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
404 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  49.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  49.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>