More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3300 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  296  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  99.32 
 
 		 159 aa  295  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 155 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 169 aa  103  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  44.36 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  33.83 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.82 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.57 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  34.26 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.25 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.08 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 144 aa  57  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 139 aa  57  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.85 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  32.84 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.85 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.85 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.32 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 180 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>