More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3295 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  93.3 
 
 
356 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  93.3 
 
 
356 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  93.3 
 
 
356 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  93.3 
 
 
356 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  93.3 
 
 
356 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  93.3 
 
 
356 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  93.3 
 
 
356 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  92.74 
 
 
356 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  95.53 
 
 
358 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  97.21 
 
 
358 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  91.34 
 
 
356 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  91.06 
 
 
356 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  93.6 
 
 
357 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  100 
 
 
358 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  91.06 
 
 
356 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  92.59 
 
 
359 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  92.59 
 
 
359 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  93.41 
 
 
348 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  86.89 
 
 
353 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  85.07 
 
 
353 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  81.09 
 
 
362 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  80.8 
 
 
363 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  79.14 
 
 
384 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0497  recombinase A  81.58 
 
 
353 aa  561  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00187604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  81.95 
 
 
377 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  85.01 
 
 
352 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  81.74 
 
 
352 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  81.74 
 
 
352 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  81.85 
 
 
345 aa  554  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  80 
 
 
384 aa  544  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5195  recA protein  82.39 
 
 
375 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0075  recombinase A  83.59 
 
 
357 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3351  recA protein  77.44 
 
 
373 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  81 
 
 
367 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4001  recA protein  77.44 
 
 
373 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.627229  normal  0.688491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0874  recA protein  81.25 
 
 
367 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.532648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4640  recA protein  81.7 
 
 
354 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  78.95 
 
 
348 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0570  recombinase A  79.53 
 
 
344 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.244041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  76.51 
 
 
345 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  73.96 
 
 
347 aa  522  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0019  recombinase A  80 
 
 
339 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  76.51 
 
 
345 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2197  recombinase A  81.07 
 
 
364 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000188561  hitchhiker  0.00000561972 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  76.47 
 
 
348 aa  515  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  76.47 
 
 
348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  80.43 
 
 
343 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  77.09 
 
 
342 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  77.4 
 
 
343 aa  515  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  77.4 
 
 
343 aa  515  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  74.63 
 
 
359 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  71.82 
 
 
361 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  69.63 
 
 
362 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  72.12 
 
 
362 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  71.82 
 
 
362 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  75.69 
 
 
347 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  72.42 
 
 
364 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  71.12 
 
 
357 aa  508  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  70.49 
 
 
363 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  70.77 
 
 
362 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  80.37 
 
 
343 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  71.82 
 
 
424 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  72.12 
 
 
361 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  72.64 
 
 
356 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  69.91 
 
 
362 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  75.69 
 
 
344 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  75.38 
 
 
347 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  76.31 
 
 
345 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  75.54 
 
 
348 aa  505  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  69.63 
 
 
364 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  69.91 
 
 
363 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  73.49 
 
 
355 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  69.63 
 
 
363 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  72.26 
 
 
360 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  71.21 
 
 
361 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  79.61 
 
 
347 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  73.33 
 
 
366 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  70.29 
 
 
357 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  75.77 
 
 
347 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  71.3 
 
 
343 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  70 
 
 
390 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  70.35 
 
 
350 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  75.23 
 
 
349 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  69.77 
 
 
354 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  71.65 
 
 
343 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  73.39 
 
 
355 aa  498  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  72.89 
 
 
346 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  72.89 
 
 
346 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  74.3 
 
 
358 aa  498  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  74.76 
 
 
365 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  74.92 
 
 
355 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  74.54 
 
 
349 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  74.92 
 
 
355 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  71.9 
 
 
354 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  71.51 
 
 
352 aa  494  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  72.76 
 
 
347 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  74.92 
 
 
355 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  73.07 
 
 
336 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  74.92 
 
 
355 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  70.76 
 
 
347 aa  494  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>