More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3267 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  97.27 
 
 		 220 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  95.45 
 
 		 220 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  89.09 
 
 		 225 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  89.55 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  89.55 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  89.09 
 
 		 220 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  89.55 
 
 		 220 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  89.09 
 
 		 220 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  89.09 
 
 		 220 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  89.09 
 
 		 220 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  89.09 
 
 		 220 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  89.09 
 
 		 220 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  88.99 
 
 		 283 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  88.53 
 
 		 241 aa  363  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  88.57 
 
 		 210 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.48 
 
 		 279 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.48 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  63.76 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.68 
 
 		 219 aa  291  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 235 aa  291  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  64.76 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  63.47 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  63.01 
 
 		 219 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  63.64 
 
 		 221 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  61.82 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 221 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  55.86 
 
 		 232 aa  262  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 220 aa  262  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  58.37 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  57.01 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  57.01 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  57.01 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  55.41 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  64.22 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.88 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  55.96 
 
 		 219 aa  254  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  58.18 
 
 		 221 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  58.18 
 
 		 221 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.88 
 
 		 220 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  56.88 
 
 		 220 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  59.17 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  57.34 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  54.59 
 
 		 220 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  59.17 
 
 		 220 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3404  response regulator transcription regulator protein  61.19 
 
 		 221 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 221 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 220 aa  247  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  62.33 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  56.02 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.16 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.82 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  55.45 
 
 		 220 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  59.36 
 
 		 221 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  57.41 
 
 		 220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  55.3 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  55.5 
 
 		 222 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  53.88 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  53.88 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  57.87 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  59.09 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  59.72 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  59.72 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  59.72 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  59.72 
 
 		 220 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 221 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  57.35 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  55.96 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  53.7 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  53.7 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  53.7 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  53.7 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  53.24 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  53.7 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.29 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  56.68 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2598  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.0460703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.83 
 
 		 219 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  52.75 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 218 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  51.83 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.24 
 
 		 227 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.83 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  51.83 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.83 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  49.08 
 
 		 221 aa  231  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  57.73 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>