More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3235 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  100 
 
 
506 aa  1029    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1197  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.45 
 
 
506 aa  724    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  67.55 
 
 
497 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2070  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.45 
 
 
859 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0501003  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  79.96 
 
 
506 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2434  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  76.63 
 
 
540 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  87.45 
 
 
511 aa  901    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  66.93 
 
 
501 aa  680    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  81.15 
 
 
506 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  78.97 
 
 
528 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  81.15 
 
 
506 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1641  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  75.45 
 
 
534 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0578251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  81.15 
 
 
506 aa  811    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0303  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  75.45 
 
 
535 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0120484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1908  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  75.25 
 
 
535 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00738158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1921  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  75.25 
 
 
535 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0857  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  75.45 
 
 
535 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  79.17 
 
 
506 aa  804    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  79.76 
 
 
506 aa  825    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  63.97 
 
 
500 aa  632  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  60.92 
 
 
496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  60.92 
 
 
496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  60.92 
 
 
496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  47.59 
 
 
499 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  47.59 
 
 
499 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.37 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  46.8 
 
 
503 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  45.01 
 
 
494 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.09 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  46.17 
 
 
501 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.38 
 
 
524 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.14 
 
 
494 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 
494 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 
494 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.96 
 
 
492 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
492 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
494 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.96 
 
 
515 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
494 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
494 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.31 
 
 
501 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
494 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  44.33 
 
 
496 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.88 
 
 
514 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.16 
 
 
503 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.15 
 
 
499 aa  430  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.58 
 
 
517 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  46.15 
 
 
500 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.31 
 
 
501 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
494 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  43.84 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 
512 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  43.84 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.42 
 
 
512 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.42 
 
 
512 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.85 
 
 
514 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.25 
 
 
520 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.85 
 
 
514 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.84 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.42 
 
 
512 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  44.13 
 
 
496 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.85 
 
 
514 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.22 
 
 
514 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.61 
 
 
513 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.95 
 
 
504 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.04 
 
 
524 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.62 
 
 
508 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
508 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 
527 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  43.43 
 
 
524 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.65 
 
 
494 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43.64 
 
 
524 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44 
 
 
497 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.41 
 
 
513 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.02 
 
 
507 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  44.06 
 
 
497 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.52 
 
 
501 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.93 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
510 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
523 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.23 
 
 
505 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.38 
 
 
495 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  42.26 
 
 
505 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  42.57 
 
 
518 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 
461 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  44.13 
 
 
500 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  43.73 
 
 
525 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.49 
 
 
495 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.69 
 
 
501 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  44.11 
 
 
511 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  44.42 
 
 
499 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.69 
 
 
501 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.42 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  43.1 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  44.44 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.95 
 
 
520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  44.94 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>