More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3218 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  100 
 
 
291 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  95.19 
 
 
291 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  81.1 
 
 
293 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  75.6 
 
 
293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  75.26 
 
 
293 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  74.91 
 
 
293 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  75.26 
 
 
293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  75.6 
 
 
293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  75.95 
 
 
293 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  75.26 
 
 
293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  73.88 
 
 
340 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  75.26 
 
 
293 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  74.57 
 
 
293 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  74.91 
 
 
293 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  74.57 
 
 
293 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  74.57 
 
 
293 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  74.57 
 
 
293 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  69.86 
 
 
293 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  70.21 
 
 
293 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  70.21 
 
 
293 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  69.86 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  69.52 
 
 
297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  70.21 
 
 
294 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  68.84 
 
 
294 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  62.63 
 
 
291 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  62.15 
 
 
289 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  60.9 
 
 
291 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  60.07 
 
 
289 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  60.07 
 
 
289 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  53.98 
 
 
305 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  55.4 
 
 
307 aa  314  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  54.17 
 
 
307 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  53.29 
 
 
294 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  52.6 
 
 
306 aa  308  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  54.36 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  51.4 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  52.43 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  52.45 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  51.9 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  51.9 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  55.75 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  51.56 
 
 
305 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  51.56 
 
 
305 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  51.9 
 
 
305 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  52.25 
 
 
304 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  53.29 
 
 
296 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  51.72 
 
 
307 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.94 
 
 
296 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  50.17 
 
 
305 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  51.03 
 
 
307 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  48.29 
 
 
311 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  50.35 
 
 
304 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  49.65 
 
 
312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  49.65 
 
 
312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  50.68 
 
 
310 aa  288  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  53.79 
 
 
296 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  49.65 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  50 
 
 
314 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  51.23 
 
 
301 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  48.79 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  49.31 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  50.88 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  49.49 
 
 
312 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  49.31 
 
 
306 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  48.14 
 
 
313 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  47.28 
 
 
311 aa  279  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  50.53 
 
 
294 aa  279  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  52.73 
 
 
274 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  48.1 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  50.17 
 
 
306 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  50.17 
 
 
290 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  49.31 
 
 
296 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  52.25 
 
 
316 aa  268  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  49.13 
 
 
307 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  45.49 
 
 
287 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  50.19 
 
 
311 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  51.7 
 
 
299 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  48.1 
 
 
297 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  45.14 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  44.18 
 
 
293 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  43.4 
 
 
290 aa  254  9e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  46.44 
 
 
310 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  44.79 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 
296 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  45.14 
 
 
293 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  42.41 
 
 
298 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  43.94 
 
 
300 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  51.56 
 
 
298 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  43.77 
 
 
286 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  42.61 
 
 
296 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  47.12 
 
 
306 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  47.27 
 
 
304 aa  238  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  46.48 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  43.02 
 
 
332 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  42.25 
 
 
315 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  40.58 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  40.6 
 
 
301 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  39.35 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  38.99 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  40 
 
 
308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>