More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3122 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  71.62 
 
 
464 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  73.58 
 
 
463 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  72.71 
 
 
482 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  71.4 
 
 
464 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  71.62 
 
 
464 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  71.62 
 
 
464 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  71.62 
 
 
464 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  75.11 
 
 
463 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  71.4 
 
 
464 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  74.24 
 
 
463 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  93.71 
 
 
461 aa  899    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  83.62 
 
 
470 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  74.24 
 
 
463 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
461 aa  948    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  74.67 
 
 
463 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  74.24 
 
 
463 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  71.62 
 
 
464 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  71.62 
 
 
464 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  58.42 
 
 
460 aa  555  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  59.03 
 
 
465 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  55.56 
 
 
478 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  53.66 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.27 
 
 
462 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  54.47 
 
 
473 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  52.99 
 
 
460 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.01 
 
 
461 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 
462 aa  487  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  52.42 
 
 
460 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  52.2 
 
 
460 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.33 
 
 
460 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  53.12 
 
 
471 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.74 
 
 
471 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.24 
 
 
471 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  51.22 
 
 
460 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  51.66 
 
 
460 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  51.22 
 
 
460 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  51.22 
 
 
460 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  53.59 
 
 
465 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  50.23 
 
 
484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  53.11 
 
 
494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  50.67 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  51.33 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  52.89 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
458 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  53.76 
 
 
489 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 
463 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  49.89 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 
463 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  52.21 
 
 
456 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  52.19 
 
 
468 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  53.5 
 
 
510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  49.02 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  50.65 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  50.65 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  50.65 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  52.36 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
463 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  49.57 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  50.54 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  48.92 
 
 
457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  49.13 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  49.78 
 
 
457 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  49.12 
 
 
481 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  48.89 
 
 
481 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  48.89 
 
 
483 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  48.89 
 
 
483 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 
480 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  49.67 
 
 
463 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 
485 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  49.68 
 
 
462 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  49.12 
 
 
483 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  49.12 
 
 
483 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  48.13 
 
 
463 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  48.89 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  49.57 
 
 
457 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  48.78 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  49.46 
 
 
460 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  48.46 
 
 
465 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  49.46 
 
 
460 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.72 
 
 
465 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  47.45 
 
 
458 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.72 
 
 
465 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 
460 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  47.69 
 
 
469 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  47.67 
 
 
446 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 
460 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>