98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3121 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3121  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0856  hypothetical protein  86.02 
 
 		 94 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0603  hypothetical protein  78.26 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2476  hypothetical protein  78.89 
 
 		 98 aa  143  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4019  hypothetical protein  70.19 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3094  hypothetical protein  79.07 
 
 		 109 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3121  proteinase inhibitor  77.91 
 
 		 146 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0915  hypothetical protein  79.76 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0436  hypothetical protein  79.76 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.452885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0885  hypothetical protein  79.76 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488999 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3059  hypothetical protein  77.91 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1510  hypothetical protein  77.91 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2573  hypothetical protein  77.91 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2040  hypothetical protein  77.91 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0740  hypothetical protein  77.91 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2170  hypothetical protein  77.91 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.298759  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0792  hypothetical protein  79.27 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0686  hypothetical protein  72.94 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0378  protein of unknown function UPF0153  70.73 
 
 		 90 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0755  hypothetical protein  70.24 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0356  hypothetical protein  69.51 
 
 		 84 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0447585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3747  protein of unknown function UPF0153  68.67 
 
 		 86 aa  116  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2765  hypothetical protein  65.85 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.443935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0649  protein of unknown function UPF0153  71.25 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572845  normal  0.0906583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0608  protein of unknown function UPF0153  71.25 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00802731  normal  0.548911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2875  hypothetical protein  67.47 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0024  hypothetical protein  63.86 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0043  protein of unknown function UPF0153  65.06 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2609  hypothetical protein  67.47 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0272  hypothetical protein  65.48 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2091  protein of unknown function UPF0153  66.67 
 
 		 83 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0939789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2707  hypothetical protein  63.53 
 
 		 99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3788  hypothetical protein  67.5 
 
 		 86 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000190416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0049  hypothetical protein  66.27 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2450  protein YeiW  65.85 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0381641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0071  hypothetical protein  67.07 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2359  protein YeiW  64.63 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000642497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2988  hypothetical protein  67.47 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3673  protein of unknown function UPF0153  67.5 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2404  hypothetical protein  64.63 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  hitchhiker  0.0000312382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3307  hypothetical protein  62.2 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161455  normal  0.0250777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2696  hypothetical protein  63.41 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2775  hypothetical protein  63.41 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0353  protein of unknown function UPF0153  65.85 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0115675  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1487  protein of unknown function UPF0153  62.2 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02100  hypothetical protein  62.2 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2318  hypothetical protein  62.2 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00260934  hitchhiker  0.00124258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02059  hypothetical protein  62.2 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3235  hypothetical protein  60.98 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2428  protein of unknown function UPF0153  60.98 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1477  hypothetical protein  60.98 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000628609  hitchhiker  0.0000139061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0038  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304383  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0040  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.140935  hitchhiker  0.000251454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1921  protein of unknown function UPF0153  57.32 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2041  hypothetical protein  61.73 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0055  hypothetical protein  61.25 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0585048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0046  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000739222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0044  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  100  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0803  hypothetical protein  75.81 
 
 		 70 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1512  hypothetical protein  62.65 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.93354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3912  hypothetical protein  62.65 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1650  hypothetical protein  54.88 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0564934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4882  hypothetical protein  60 
 
 		 83 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2331  protein of unknown function UPF0153  59.76 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2510  hypothetical protein  60 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0872529  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4337  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306758  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3811  hypothetical protein  61.73 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214494  normal  0.3125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0035  hypothetical protein  61.25 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0575  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000579653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0038  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0042  protein of unknown function UPF0153  62.5 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4110  hypothetical protein  61.25 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1932  hypothetical protein  58.54 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3703  hypothetical protein  57.5 
 
 		 83 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4025  hypothetical protein  60 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2192  hypothetical protein  56.25 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4475  hypothetical protein  57.5 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000150782  decreased coverage  0.00000000228641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44090  putative Fe-S-cluster oxidoreductase  57.5 
 
 		 84 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3519  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1006  hypothetical protein  56.25 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3749  Fe-S-cluster domain-containing protein  57.5 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3767  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2002  hypothetical protein  53.75 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.786219  normal  0.232569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4195  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0876839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1658  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29830  hypothetical protein  56.79 
 
 		 83 aa  90.1  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4222  hypothetical protein  53.09 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0791  hypothetical protein  60.56 
 
 		 73 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4193  hypothetical protein  62.9 
 
 		 62 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03942  proteinase inhibitor  58.06 
 
 		 62 aa  74.7  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0699  hypothetical protein  56.67 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00386805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0042  hypothetical protein  55 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0871438  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002895  hypothetical protein  53.33 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03079  hypothetical protein  51.67 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2457  hypothetical protein  48.28 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0579  protein of unknown function UPF0153  45.28 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0592  protein of unknown function UPF0153  45.28 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00030944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0636  hypothetical protein  44.83 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>