299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3033 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  100 
 
 		 493 aa  1000    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  90.18 
 
 		 479 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  84.52 
 
 		 405 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  83.9 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  86.52 
 
 		 444 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  86.52 
 
 		 442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  86.52 
 
 		 442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  86.21 
 
 		 444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  86.52 
 
 		 444 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  86.52 
 
 		 444 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  84.76 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  86.52 
 
 		 442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  86.21 
 
 		 356 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  84.19 
 
 		 396 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  84.19 
 
 		 396 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  84.19 
 
 		 396 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  97.21 
 
 		 251 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  87.25 
 
 		 251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  61.15 
 
 		 260 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  57.71 
 
 		 266 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  56.37 
 
 		 258 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  51.15 
 
 		 285 aa  262  8.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  47.41 
 
 		 272 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  47.27 
 
 		 313 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  47.35 
 
 		 305 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  47.35 
 
 		 305 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  45.42 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  46.33 
 
 		 258 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  47.64 
 
 		 295 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  45.28 
 
 		 293 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  35.2 
 
 		 238 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  42.11 
 
 		 233 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  42.44 
 
 		 241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  41.34 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  38.32 
 
 		 229 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  37.56 
 
 		 312 aa  120  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  43.03 
 
 		 244 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  38.14 
 
 		 256 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36.6 
 
 		 250 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  37.04 
 
 		 248 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  36.87 
 
 		 253 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  38.83 
 
 		 261 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  42.51 
 
 		 250 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  42.51 
 
 		 250 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  38.69 
 
 		 231 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  38.62 
 
 		 238 aa  114  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  35.75 
 
 		 247 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  37.65 
 
 		 245 aa  114  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  40.48 
 
 		 262 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  43.1 
 
 		 255 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  35 
 
 		 268 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  37.02 
 
 		 242 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  40.35 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.64 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  40 
 
 		 240 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  39.88 
 
 		 238 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  34.53 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  35.68 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  34.71 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  34.53 
 
 		 279 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  34.53 
 
 		 279 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  35.93 
 
 		 229 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  34.08 
 
 		 268 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  40.46 
 
 		 233 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  39.29 
 
 		 252 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  34.98 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  34.91 
 
 		 238 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.95 
 
 		 237 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.37 
 
 		 250 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  34.98 
 
 		 268 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  35.5 
 
 		 259 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  39.41 
 
 		 235 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  35 
 
 		 264 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  35.58 
 
 		 273 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  36.93 
 
 		 241 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  35.9 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  34.76 
 
 		 268 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  40.35 
 
 		 251 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  38.01 
 
 		 238 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  39.26 
 
 		 272 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  34.4 
 
 		 263 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.89 
 
 		 255 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  40.24 
 
 		 251 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.25 
 
 		 255 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  40.24 
 
 		 240 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  40.24 
 
 		 240 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  32.02 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  33.99 
 
 		 267 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  39.44 
 
 		 261 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.99 
 
 		 230 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.67 
 
 		 231 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  35.4 
 
 		 259 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  39.01 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  38.04 
 
 		 227 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  35.8 
 
 		 237 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  40.48 
 
 		 222 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.96 
 
 		 279 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  40 
 
 		 238 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  34.73 
 
 		 242 aa  100  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  33.33 
 
 		 276 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>