More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3027 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  86.15 
 
 		 130 aa  216  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  61.96 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  59.79 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  52.43 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 125 aa  83.6  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  45.56 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  41.11 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  40 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  41.05 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  48.15 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  35.05 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  32.61 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1048  hypothetical protein  39.36 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  37.86 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>