262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2821 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  97.67 
 
 
343 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  93.59 
 
 
343 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  100 
 
 
343 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  83.53 
 
 
348 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  83.58 
 
 
348 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  83.33 
 
 
346 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  83.04 
 
 
350 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  81.82 
 
 
345 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  75.82 
 
 
364 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  63.61 
 
 
346 aa  481  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  66.17 
 
 
346 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  64.91 
 
 
346 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  65.5 
 
 
346 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  64.22 
 
 
346 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  64.31 
 
 
346 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  66.17 
 
 
346 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  63.74 
 
 
346 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  63.82 
 
 
351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  64.62 
 
 
346 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  62.31 
 
 
353 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.72 
 
 
352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  65.38 
 
 
361 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  61.99 
 
 
355 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  64.81 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  65.4 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  64.81 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  63.45 
 
 
349 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  65.09 
 
 
361 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  65.09 
 
 
371 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  65.98 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  62.91 
 
 
347 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  64.62 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  62.39 
 
 
353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  64.99 
 
 
346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  61.72 
 
 
348 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  58.11 
 
 
362 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  54.46 
 
 
350 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  57.85 
 
 
350 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.16 
 
 
356 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  42.94 
 
 
349 aa  292  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  44.44 
 
 
340 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  48.08 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  47.76 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  44.71 
 
 
346 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  48.68 
 
 
362 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  47.65 
 
 
351 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  41.48 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.41 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  44.95 
 
 
365 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  43.1 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  48.83 
 
 
339 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  47.32 
 
 
365 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  48.53 
 
 
368 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  46.76 
 
 
359 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  45.75 
 
 
350 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  44.38 
 
 
345 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  46.18 
 
 
353 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  45.65 
 
 
375 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  47.48 
 
 
369 aa  258  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  43.7 
 
 
341 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  45.32 
 
 
357 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  42.31 
 
 
341 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  47.24 
 
 
352 aa  255  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  41.52 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  42.27 
 
 
348 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  42.63 
 
 
353 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  40.99 
 
 
352 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  42.2 
 
 
351 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  41.62 
 
 
350 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  45.98 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.1 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  46.94 
 
 
358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  46.94 
 
 
358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  42.86 
 
 
350 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  46.65 
 
 
358 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  42.41 
 
 
336 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  45.56 
 
 
341 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  39.94 
 
 
338 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  47.1 
 
 
353 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  42.57 
 
 
340 aa  235  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  42.31 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  39.71 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  39.42 
 
 
349 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  41 
 
 
343 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  44.19 
 
 
339 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  41.57 
 
 
357 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  43.96 
 
 
374 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  38.51 
 
 
349 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  40.29 
 
 
352 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  40.57 
 
 
350 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  39.95 
 
 
387 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  39.37 
 
 
357 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  33.05 
 
 
344 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  32.94 
 
 
345 aa  159  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  31.5 
 
 
342 aa  159  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  30.81 
 
 
350 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1756  hypothetical protein  33.04 
 
 
341 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  31.7 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28.99 
 
 
344 aa  146  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  29.43 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0576287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>